RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM201AQ5SY85 155 aa8.97□□□□□ -0.97
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SH3BP2-209ENST00000504450 OR2C3Q8N628 320 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP2-209ENST00000504450 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa8.97□□□□□ -0.97
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SH3BP2-209ENST00000504450 TMED6Q8WW62 240 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP2-209ENST00000504450 AGMATQ9BSE5 352 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP2-209ENST00000504450 OR2S2Q9NQN1 319 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP2-209ENST00000504450 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP2-209ENST00000504450 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
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SH3BP2-209ENST00000504450 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 IGSF23A1L1A6 192 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 C17orf100A8MU93 164 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 SHISA9B4DS77 424 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 ITGB1BP1O14713 200 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 SPINT2O43291 252 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 YPEL1O60688 119 aa8.96□□□□□ -0.98
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SH3BP2-209ENST00000504450 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
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SH3BP2-209ENST00000504450 SULT1A2P50226 295 aa8.96□□□□□ -0.98
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SH3BP2-209ENST00000504450 RPL30P62888 115 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP8.96□□□□□ -0.98
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SH3BP2-209ENST00000504450 SWI5Q1ZZU3 235 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
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SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF561Q8N587 486 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM252Q8N6L7 170 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNRF1Q8ND25 227 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 OR1S2Q8NGQ3 325 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 RFESDQ8TAC1 157 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 C14orf79Q96F83 325 aa8.96□□□□□ -0.98
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SH3BP2-209ENST00000504450 GAB2Q9UQC2 676 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 LRRK2Q5S007 2527 aa8.96□□□□□ -0.98
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SH3BP2-209ENST00000504450 IGHV3-43DP0DP04 118 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 SELLP14151 372 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 TNFRSF1AP19438 455 aa8.94□□□□□ -0.98
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SH3BP2-209ENST00000504450 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM209AQ5JX71 171 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa8.94□□□□□ -0.98
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