RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 TP53RKQ96S44 253 aa5.51□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 SPIN2AQ99865 258 aa5.51□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa5.51□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 MFFQ9GZY8 342 aa5.51□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 PLSCR3Q9NRY6 295 aa5.51□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 CALYQ9NYX4 217 aa5.51□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 GSKIPQ9P0R6 139 aa5.51□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 LPAR3Q9UBY5 353 aa5.51□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 JPT1Q9UK76 154 aa5.51□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 TMED3Q9Y3Q3 217 aa5.51□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa5.51□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 RTTNQ86VV8 2226 aa5.51□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 A0A0D9SG52 128 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 C15orf65H3BRN8 121 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 F2RL2O00254 374 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 RGS13O14921 159 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 ARPC5O15511 151 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 ADAM20O43506 726 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 GOSR1O95249 250 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 MPC2O95563 127 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 FSTL3O95633 263 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 WNT2P09544 360 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 SELLP14151 372 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 RPA2P15927 270 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 UCP1P25874 307 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 IFITM2Q01629 132 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 OPCMLQ14982 345 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 LTC4SQ16873 150 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 LYZL2Q7Z4W2 148 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF645Q8N7E2 425 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 GLYATL2Q8WU03 294 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 CORO2AQ92828 525 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 TIMD4Q96H15 378 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 C18orf12Q96KH6 178 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 OR10C1Q96KK4 312 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 DCTN5Q9BTE1 182 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 OR2D2Q9H210 308 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 TAS2R3Q9NYW6 316 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 KAAG1Q9UBP8 84 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 CLN8Q9UBY8 286 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 PFDN2Q9UHV9 154 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 RNF150Q9ULK6 438 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 LINC00312Q9Y6C7 94 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 SHANK1Q9Y566 2161 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 ZGRF1Q86YA3 2104 aa5.5□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 MAST4O15021 2626 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 A0A1B0GW55 424 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 ITGB1BP1O14713 200 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 YPEL1O60688 119 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 ATG12O94817 140 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 OR2F2O95006 317 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 CDS2O95674 445 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 DUX4L2P0CJ85 424 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 DUX4L3P0CJ86 424 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 DUX4L4P0CJ87 422 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 DUX4L5P0CJ88 424 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 DUX4L6P0CJ89 424 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 DUX4L7P0CJ90 424 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 CGB3P0DN86 165 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 CGB7P0DN87 165 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 IGHV3-43DP0DP04 118 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 CXCL2P19875 107 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 VDAC1P21796 283 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 SSTR2P30874 369 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 S100A11P31949 105 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 GPR12P47775 334 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 RAB7AP51149 207 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 S100A10P60903 97 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 RPL31P62899 125 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 CATR1Q13166 79 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 OR2F1Q13607 317 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 GNMTQ14749 295 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 PRSS54Q6PEW0 395 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF66Q6ZN08 573 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 TMUB2Q71RG4 321 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF767PQ75MW2 155 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 DTX2Q86UW9 622 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 DRAM1Q8N682 238 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 SLC35G3Q8N808 338 aa5.49□□□□□ -1.53
HDAC8-211ENST00000415409 OR10A7Q8NGE5 316 aa5.49□□□□□ -1.53
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