RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AIFM2Q9BRQ8 373 aa9.97□□□□□ -0.81
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UFSP2Q9NUQ7 469 aa9.97□□□□□ -0.81
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF266Q14584 549 aa9.96□□□□□ -0.81
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 S100GP29377 79 aa9.95□□□□□ -0.82
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR2B11Q5JQS5 317 aa9.95□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa9.95□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CD300LFQ8TDQ1 290 aa9.95□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IFT22Q9H7X7 185 aa9.95□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ASCL3Q9NQ33 180 aa9.95□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF318Q5VUA4 2279 aa9.95□□□□□ -0.82
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SH2D1BO14796 132 aa9.95□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGKV1-5P01602 117 aa9.95□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF585BQ52M93 769 aa9.95□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AWAT1Q58HT5 328 aa9.95□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR1L1Q8NH94 360 aa9.95□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C14orf79Q96F83 325 aa9.95□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COLCA2A8K830 154 aa9.94□□□□□ -0.82
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TXNL1O43396 289 aa9.94□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HAND1O96004 215 aa9.94□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHG3P01860 377 aa9.94□□□□□ -0.82
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RAB5CP51148 216 aa9.94□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CEBPGP53567 150 aa9.94□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF146Q15072 292 aa9.94□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DEFB109BQ30KR1 87 aa9.94□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q6ZR03 302 aa9.94□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PIP4P1Q86T03 277 aa9.94□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WDR31Q8NA23 367 aa9.94□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IQCF6A8MYZ5 107 aa9.94□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UMAD1C9J7I0 102 aa9.94□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR3A1P47881 315 aa9.94□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LINC00205P59089 165 aa9.94□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HNF4GQ14541 408 aa9.94□□□□□ -0.82
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DRAM1Q8N682 238 aa9.94□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 METRNQ9UJH8 293 aa9.94□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KPTNQ9Y664 436 aa9.94□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa9.93□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C7orf77A4D0Y5 90 aa9.93□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FBP1P09467 338 aa9.93□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 METTL15P1P0C7V9 234 aa9.93□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLA2G5P39877 138 aa9.93□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HAGHQ16775 308 aa9.93□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPSB3Q6PJ21 355 aa9.93□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR52L2PQ8NGH6 319 aa9.93□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa9.93□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KALRNO60229 2985 aa9.93□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RAMP3O60896 148 aa9.93□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP9.93□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CECR9P0C854 216 aa9.93□□□□□ -0.82
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