RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296695.9

SPINK1-201, Transcript of serine peptidase inhibitor, Kazal type 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPINK1, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINK1-201ENST00000296695 TMEM38BQ9NVV0 291 aa3.41□□□□□ -1.86
SPINK1-201ENST00000296695 DLL3Q9NYJ7 618 aa3.41□□□□□ -1.86
SPINK1-201ENST00000296695 VAX2Q9UIW0 290 aa3.41□□□□□ -1.86
SPINK1-201ENST00000296695 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa3.41□□□□□ -1.86
SPINK1-201ENST00000296695 MMP24Q9Y5R2 645 aa3.41□□□□□ -1.86
SPINK1-201ENST00000296695 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
SPINK1-201ENST00000296695 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
SPINK1-201ENST00000296695 LOC400499M0QZD8 3231 aa3.4□□□□□ -1.86
SPINK1-201ENST00000296695 A0A1B0GV90 55 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 SHISA7A6NL88 538 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 C2CD4DB7Z1M9 353 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 ZNF814B7Z6K7 855 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 FAM90A26D6RGX4 464 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 E9PLN8 166 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 DVL1O14640 695 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 CYB5BO43169 146 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 ADAM20O43506 726 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 ANGPTL7O43827 346 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 CHST1O43916 411 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 SOX15O60248 233 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 HIST1H2BKO60814 126 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 RAMP1O60894 148 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 TUSC2O75896 110 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 C1QL1O75973 258 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 LY86O95711 162 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 NAPSAO96009 420 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 IGHEP01854 428 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 MBP02144 154 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 HIST1H2BJP06899 126 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 SERPINE2P07093 398 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 CD63P08962 238 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 BCL2P10415 239 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 RAB4AP20338 218 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 FGF7P21781 194 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 HIST1H2BOP23527 126 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 SRD5A2P31213 254 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 HIST1H2BBP33778 126 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 APLNRP35414 380 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 SSR4P51571 173 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 DYNLT3P51808 116 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 GFRA1P56159 465 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 HIST1H2BDP58876 126 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 FGF12P61328 243 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 HIST1H2BCP62807 126 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 ZNF92Q03936 586 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 IL11RAQ14626 422 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 HAGHQ16775 308 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 HIST2H2BEQ16778 126 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 CR1LQ2VPA4 569 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 SNAI3Q3KNW1 292 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 PIGYQ3MUY2 71 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 TRIM61Q5EBN2 209 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 PYY3Q5JQD4 70 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 PHYHD1Q5SRE7 291 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 NCMAPQ5T1S8 102 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 TSPO2Q5TGU0 170 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 OR2T2Q6IF00 324 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 Q6ZS52 159 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 MOB1BQ7L9L4 216 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 AAED1Q7RTV5 226 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 PPP1R3BQ86XI6 285 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 HIST3H2BBQ8N257 126 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 ZIC4Q8N9L1 334 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 ZNF383Q8NA42 475 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 OR10D4PQ8NGN7 298 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 AKR7LQ8NHP1 331 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 Q8TCH9 128 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 Q8WTZ3 238 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 DNASE2BQ8WZ79 361 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 EXTL1Q92935 676 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 NAT6Q93015 286 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 HIST1H2BHQ93079 126 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 S100PBPQ96BU1 408 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 FBXO17Q96EF6 278 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 ACY3Q96HD9 319 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 OR6C1Q96RD1 312 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 FOXB1Q99853 325 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 HIST1H2BNQ99877 126 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 HIST1H2BMQ99879 126 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 C2orf88Q9BSF0 95 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 TPSD1Q9BZJ3 242 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 GPR61Q9BZJ8 451 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 OR2H1Q9GZK4 316 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 LIME1Q9H400 295 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 SMOC1Q9H4F8 434 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 SRD5A3Q9H8P0 318 aa3.4□□□□□ -1.87
SPINK1-201ENST00000296695 Q9N2K0 584 aa3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms