RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 FCMRO60667 390 aa6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 WISP1O95388 367 aa6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 P04436 131 aa6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 SMIM21Q3B7S5 101 aa6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 FAM220AQ7Z4H9 259 aa6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 OR4K13Q8NH42 304 aa6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 TMEM230Q96A57 120 aa6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 TMEM18Q96B42 140 aa6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ACY3Q96HD9 319 aa6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 MED31Q9Y3C7 131 aa6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 A0A1W2PNV4 684 aa6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ABHD16AO95870 558 aa6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 IGHMP01871 453 aa6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 CRYGCP07315 174 aa6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 KLK2P20151 261 aa6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 S100A10P60903 97 aa6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 OR1Q1Q15612 314 aa6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ALG10BQ5I7T1 473 aa6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 OR8G5Q8NG78 346 aa6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 MARCH1Q8TCQ1 289 aa6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ERGIC1Q969X5 290 aa6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 TMEM45BQ96B21 275 aa6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 MAGT1Q9H0U3 335 aa6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 ST3GAL6Q9Y274 331 aa6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 LIPGQ9Y5X9 500 aa6.59□□□□□ -1.35
USP4-211ENST00000485450 TMEM212A6NML5 194 aa6.59□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 CEACAM18A8MTB9 384 aa6.59□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 XKRYO14609 159 aa6.59□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 WISP2O76076 250 aa6.59□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 FUT3P21217 361 aa6.59□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 COL10A1Q03692 680 aa6.59□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 ANKRD55Q3KP44 614 aa6.59□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 SLC22A6Q4U2R8 563 aa6.59□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 MORN2Q502X0 79 aa6.59□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 EIPR1Q53HC9 387 aa6.59□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 TCF24Q7RTU0 167 aa6.59□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 OR10AC1Q8NH08 325 aa6.59□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 FAM222BQ8WU58 562 aa6.59□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa6.59□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 KNL1Q8NG31 2342 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 TRAV39A0A0B4J263 110 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 A0A0B4J2E0 115 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 A0A1B0GX12 115 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 CLDN34H7C241 214 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 FAHP16930 419 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 OR10J1P30954 320 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 PTGER1P34995 402 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 HRH1P35367 487 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 P2RY1P47900 373 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 COMPP49747 757 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 MMDQ15546 238 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 LINC00696Q6ZRV3 163 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 COX18Q8N8Q8 333 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 OR51A4Q8NGJ6 313 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 SRD5A3Q9H8P0 318 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 ELOVL5Q9NYP7 299 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 GPR132Q9UNW8 380 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 COX11Q9Y6N1 276 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 F6UZH7 168 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 K7N7A8 449 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 DEDDO75618 318 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 PRH1P02810 166 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 RND3P61587 244 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 RHOGP84095 191 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 ZP4Q12836 540 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 P2RY6Q15077 328 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 BATFQ16520 125 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 C1QL3Q5VWW1 255 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 FAM180AQ6UWF9 173 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 DOLPP1Q86YN1 238 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 NPEPL1Q8NDH3 523 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 ADAMTS15Q8TE58 950 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 PTX4Q96A99 478 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 NICN1Q9BSH3 213 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 SMIM3Q9BZL3 60 aa6.58□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 C5orf66Q9H5L9 145 aa6.58□□□□□ -1.36
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