RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 BEND2Q8NDZ0 799 aa11.29□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 HS3ST6Q96QI5 342 aa11.29□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 GPHA2Q96T91 129 aa11.29□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 SNHG12Q9BXW3 62 aa11.29□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 GPR87Q9BY21 358 aa11.29□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 PRDM6Q9NQX0 595 aa11.29□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 KIAA1456Q9P272 454 aa11.29□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 FAM24AA6NFZ4 105 aa11.29□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 TRDCB7Z8K6 153 aa11.29□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 CELA3AP09093 270 aa11.29□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 SCTP09683 121 aa11.29□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 TDGF1P13385 188 aa11.29□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 SLC10A1Q14973 349 aa11.29□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 P4HA3Q7Z4N8 544 aa11.29□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 TUSC5Q8IXB3 177 aa11.29□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM183AQ8IXX5 376 aa11.29□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 C17orf78Q8N4C9 275 aa11.29□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 OR4D5Q8NGN0 318 aa11.29□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM45BQ96B21 275 aa11.29□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 PLSCR2Q9NRY7 297 aa11.29□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 CRIM1Q9NZV1 1036 aa11.29□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 PITPNC1Q9UKF7 332 aa11.29□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 OMGP23515 440 aa11.28□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP11.28□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 SLC35E3Q7Z769 313 aa11.28□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 PSMF1Q92530 271 aa11.28□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 PRRG4Q9BZD6 226 aa11.28□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM222Q9H0R3 208 aa11.28□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 MAGT1Q9H0U3 335 aa11.28□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 FREM1Q5H8C1 2179 aa11.28□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 FAM166BA8MTA8 275 aa11.28□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF732B4DXR9 585 aa11.28□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 SYNGR4O95473 234 aa11.28□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 MBP02144 154 aa11.28□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 SPINK2P20155 84 aa11.28□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 SRPXP78539 464 aa11.28□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 COLCA1Q6ZS62 124 aa11.28□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa11.28□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 FAM185AQ8N0U4 392 aa11.28□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 OR2C3Q8N628 320 aa11.28□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 HES7Q9BYE0 225 aa11.28□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 Q9N2K0 584 aa11.28□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 IL36RNQ9UBH0 155 aa11.28□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 DOCK10Q96BY6 2186 aa11.27□□□□□ -0.6
TMOD1-202ENST00000375175 TRAPPC2LH3BP13 241 aa11.27□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 HLA-DRB3P79483 266 aa11.27□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF506Q5JVG8 444 aa11.27□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa11.27□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 GAPTQ8N292 157 aa11.27□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 OR2M7Q8NG81 312 aa11.27□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 BOD1Q96IK1 185 aa11.27□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa11.27□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa11.27□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 PRO3102Q9H379 93 aa11.27□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 FREM2Q5SZK8 3169 aa11.27□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 SSSCA1O60232 199 aa11.27□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 CDS2O95674 445 aa11.27□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 FGF12P61328 243 aa11.27□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 VAMP2P63027 116 aa11.27□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 CEACAM21Q3KPI0 293 aa11.27□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF880Q6PDB4 577 aa11.27□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 MKXQ8IYA7 352 aa11.27□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 FAM173AQ9BQD7 235 aa11.27□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa11.26□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 MARCH11A6NNE9 402 aa11.26□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 ADAM20O43506 726 aa11.26□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 NXPH3O95157 252 aa11.26□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 JMJD7P0C870 316 aa11.26□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 NRN1LQ496H8 165 aa11.26□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 ABHD17BQ5VST6 288 aa11.26□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM105Q8N8V8 129 aa11.26□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 OR4X1Q8NH49 305 aa11.26□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 SPIN2AQ99865 258 aa11.26□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa11.26□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 MTCH1Q9NZJ7 389 aa11.26□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 B4GALT7Q9UBV7 327 aa11.26□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa11.26□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 IGSF23A1L1A6 192 aa11.26□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 FAM90A10PA6NDY2 464 aa11.26□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 FAM90A18PA6NE21 464 aa11.26□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 FAM90A16PA6NEW6 464 aa11.26□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa11.26□□□□□ -0.61
TMOD1-202ENST00000375175 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 127.8 ms