RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596941.5

GTPBP3-215, Transcript of GTP binding protein 3, mitochondrial, human

TSL 2

Gene GTPBP3, Length 678 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP3-215	ENST00000596941	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	VHL	P40337	213 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	GPR176	Q14439	515 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	CDH26	Q8IXH8	852 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	CCDC107	Q8WV48	283 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	THRSP	Q92748	146 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	TMED9	Q9BVK6	235 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	ERICH4	A6NGS2	130 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR2F2	O95006	317 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	AMY1A	P04745	511 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	AMY2A	P04746	511 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	MYF6	P23409	242 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	ARHGDIB	P52566	201 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	SPHAR	Q15513	63 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR56B4	Q8NH76	319 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	MYDGF	Q969H8	173 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	RPE	Q96AT9	228 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941		Q96M66	194 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	SCN3B	Q9NY72	215 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	AIP	O00170	330 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	SC5D	O75845	299 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	MT-ND4	P03905	459 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	MNDA	P41218	407 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	MED22	Q15528	200 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	RAB12	Q6IQ22	244 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	ARL11	Q969Q4	196 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	FAM46B	Q96A09	425 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	DUSP21	Q9H596	190 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	GZMH	P20718	246 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	LOXL3	P58215	753 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	MADCAM1	Q13477	382 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	GPR50	Q13585	617 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR10K2	Q6IF99	312 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	C1QL4	Q86Z23	238 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	GAPT	Q8N292	157 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	DRAM1	Q8N682	238 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR4K15	Q8NH41	348 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	KCNK15	Q9H427	330 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	ETAA1	Q9NY74	926 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GTPBP3-215	ENST00000596941	C12orf77	C9JDV5	145 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GTPBP3-215	ENST00000596941	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GTPBP3-215	ENST00000596941		H0YHG0	523 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GTPBP3-215	ENST00000596941	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
GTPBP3-215	ENST00000596941	ORC5	O43913	435 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GTPBP3-215	ENST00000596941	PEX14	O75381	377 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GTPBP3-215	ENST00000596941	LPL	P06858	475 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GTPBP3-215	ENST00000596941	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GTPBP3-215	ENST00000596941	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GTPBP3-215	ENST00000596941	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GTPBP3-215	ENST00000596941	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GTPBP3-215	ENST00000596941	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GTPBP3-215	ENST00000596941	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GTPBP3-215	ENST00000596941	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GTPBP3-215	ENST00000596941	HSD17B6	O14756	317 aa		13.94	□□□□□ -0.18

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