RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 OR3A1P47881 315 aa18.98■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 CD83Q01151 205 aa18.98■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 AADACL3Q5VUY0 350 aa18.98■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 ANGPTL6Q8NI99 470 aa18.98■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa18.98■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM216AQ8WUB2 273 aa18.98■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 NEUROG1Q92886 237 aa18.98■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 GALMQ96C23 342 aa18.98■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 PPYP01298 95 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 VSIG10L2P0DP72 767 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 ERP29P30040 261 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 FCN2Q15485 313 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 MST1LQ2TV78 715 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM30BQ3MIR4 351 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 STUMQ69YW2 141 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 CMTM1Q8IZ96 169 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 CD177Q8N6Q3 437 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 MGAT4CQ9UBM8 478 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 LPAR3Q9UBY5 353 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 CADP27708 2225 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 HCFC1P51610 2035 aa18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A0B4J2A0 478 aa18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 OR5H14A6NHG9 310 aa18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 C3orf80F5H4A9 247 aa18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM178BH3BS89 294 aa18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 K7N7A8 449 aa18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 PSPNO60542 156 aa18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 FSTL3O95633 263 aa18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 PLAUP00749 431 aa18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 ZBTB25P24278 435 aa18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 LOXP28300 417 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 DHRS2Q13268 280 aa18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 HMGN3Q15651 99 aa18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 C17orf107Q6ZR85 190 aa18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 CCL17Q92583 94 aa18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 TOMM40LQ969M1 308 aa18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 TAF9BQ9HBM6 251 aa18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 SHPKQ9UHJ6 478 aa18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa18.95■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa18.95■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 C9orf170A2RU37 121 aa18.95■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 HPXP02790 462 aa18.95■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 SCTP09683 121 aa18.95■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 FXYD4P59646 89 aa18.95■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 AESQ08117 197 aa18.95■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 UXS1Q8NBZ7 420 aa18.95■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 OR2AK2Q8NG84 335 aa18.95■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 KIF25Q9UIL4 384 aa18.95■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 SIAH2O43255 324 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF737O75373 536 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 B3GALNT1O75752 331 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 SFT2D2O95562 160 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 GIPP09681 153 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 AADACP22760 399 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 RBMXP38159 391 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 P2RX3P56373 397 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 RAP2BP61225 183 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 SRPXP78539 464 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 DHODHQ02127 395 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 IGSF11Q5DX21 431 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 MITD1Q8WV92 249 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 IL1F10Q8WWZ1 152 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 TIMD4Q96H15 378 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 ST6GAL2Q96JF0 529 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 C5orf66Q9H5L9 145 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 OR2W1Q9Y3N9 320 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 ODAMA1E959 279 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 SIGLEC5O15389 551 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC22A5O76082 557 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 RGS11O94810 467 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 IFNA2P01563 188 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 IGFBP2P18065 325 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 LUMP51884 338 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP1R1AQ13522 171 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 EDDM3AQ14507 147 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF788Q6ZQV5 615 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 CAPSLQ8WWF8 208 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 MRGPRFQ96AM1 343 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 RSRP1Q9BUV0 290 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 CREBBPQ92793 2442 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms