RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, human

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMOD3-208	ENST00000560725	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725		B4DSR2	109 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	AIM2	O14862	343 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	HDAC3	O15379	428 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	RNF13	O43567	381 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	TCF21	O43680	179 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	ENTPD5	O75356	428 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	LY6H	O94772	140 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	CECR9	P0C854	216 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	GKN3P	P0CG01	181 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	GLP1R	P43220	463 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	TMEM33	P57088	247 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	DSTN	P60981	165 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	RAP1B	P61224	184 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	BNIP2	Q12982	314 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	FADD	Q13158	208 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	ARFRP1	Q13795	201 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	ZSCAN26	Q16670	478 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	SLC38A4	Q969I6	547 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	TEX37	Q96LM6	180 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	SORT1	Q99523	831 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	MFF	Q9GZY8	342 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	CR1	P17927	2039 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	FBN3	Q75N90	2809 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	ZNF726	A6NNF4	738 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	C5orf58	C9J3I9	102 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	SOX15	O60248	233 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	MGRN1	O60291	552 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	BCHE	P06276	602 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	ADRA2A	P08913	450 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	BGN	P21810	368 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	GLRX	P35754	106 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	CDKN2C	P42773	168 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	SLC18A1	P54219	525 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	PRRX1	P54821	245 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	ERVK-25	P63136	954 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	RGN	Q15493	299 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	MOG	Q16653	247 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	KRT71	Q3SY84	523 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	HHAT	Q5VTY9	493 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	ULK3	Q6PHR2	472 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	ZNF546	Q86UE3	836 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	RDH5	Q92781	318 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	CRLF2	Q9HC73	371 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	NUP50	Q9UKX7	468 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	COL6A5	A8TX70	2615 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725		A0A087WUJ7	227 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	SMCO3	A2RU48	225 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725		M0R233	179 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	UBD	O15205	165 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	SERPINB7	O75635	380 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	UBL3	O95164	117 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	RAB36	O95755	333 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	PTH	P01270	115 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	C1QC	P02747	245 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	ZNF35	P13682	527 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	GAL	P22466	123 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	GABRR1	P24046	479 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	GSS	P48637	474 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	DLX1	P56177	255 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	ATP6AP1	Q15904	470 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TMOD3-208	ENST00000560725	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		4.18	□□□□□ -1.74

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