RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 WDR86Q86TI4 376 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 BATF2Q8N1L9 274 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM185AQ8NFB2 350 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 DYRK2Q92630 601 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 C12orf4Q9NQ89 552 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 MGAT4AQ9UM21 535 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 C9orf170A2RU37 121 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 C17orf100A8MU93 164 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 RP2O75695 350 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 TGFAP01135 160 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 GSTT2P0CG29 244 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 KITLGP21583 273 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 DHODHQ02127 395 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 IL13RA2Q14627 380 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 PDCD1Q15116 288 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 BRICD5Q6PL45 260 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 CHIAQ9BZP6 476 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 C5orf66Q9H5L9 145 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 SLA2Q9H6Q3 261 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 GOSR2O14653 212 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 IGHV3-13P01766 116 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 FAM157CP0CG43 387 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 NPY4RP50391 375 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 ARPC4P59998 168 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 CCL8P80075 99 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 MITD1Q8WV92 249 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 RDH5Q92781 318 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 GON7Q9BXV9 100 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 DECR2Q9NUI1 292 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 IL36RNQ9UBH0 155 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 OPN4Q9UHM6 478 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 HSPB11Q9Y547 144 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXC6-201ENST00000243108 STAB1Q9NY15 2570 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 OR5H14A6NHG9 310 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM210A6NLX4 147 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 SLC22A5O76082 557 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 PRKACAP17612 351 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 ECI1P42126 302 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM128Q5BJH2 165 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 FAM120AOSQ5T036 256 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 Q6ZPA2 131 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 Q6ZS49 121 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 UXS1Q8NBZ7 420 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 OR8G5Q8NG78 346 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 IFT22Q9H7X7 185 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 KCNS2Q9ULS6 477 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 A0A1B0GWJ7 208 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 F5H5P2 479 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 RHBDL1O75783 438 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 RGS11O94810 467 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 SIX6O95475 246 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 HLA-GP17693 338 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 CD34P28906 385 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 ERVK11-1P61568 191 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 IL13RA1P78552 427 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF718Q3SXZ3 478 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 LY6G6FQ5SQ64 297 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 DCAF12L2Q5VW00 463 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 LPCAT3Q6P1A2 487 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 Q8IYB0 196 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 FAM58AQ8N1B3 248 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 SCCPDHQ8NBX0 429 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM230Q96A57 120 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 C1orf159Q96HA4 380 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF488Q96MN9 340 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 NARFLQ9H6Q4 476 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF286AQ9HBT8 521 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 SPACA1Q9HBV2 294 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 NECAP2Q9NVZ3 263 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 NAPSAO96009 420 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 GLAP06280 429 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 OR5H8P0DN80 308 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 SELENOVP59797 346 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF154Q13106 437 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 OR8G1Q15617 311 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 DHRS11Q6UWP2 260 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 OR5M8Q8NGP6 311 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 CLDND2Q8NHS1 167 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 SHARPINQ9H0F6 387 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM100Q9NV29 134 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 TANC2Q9HCD6 1990 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC6-201ENST00000243108 MLNRO43193 412 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms