RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 FCN3O75636 299 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 F12P00748 615 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 CD34P28906 385 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 PRDX2P32119 198 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 CDK10Q15131 360 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 LYZL2Q7Z4W2 148 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 GAPTQ8N292 157 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 LHFPL5Q8TAF8 219 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 CXXC4Q9H2H0 198 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 SAP30LQ9HAJ7 183 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 GPR132Q9UNW8 380 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 M0R233 179 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 ST8SIA5O15466 376 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF250P15622 560 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 CCL3L1P16619 93 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 PTAFRP25105 342 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 ERVK11-1P61568 191 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF626Q68DY1 528 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 PRRT1Q99946 306 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 SHARPINQ9H0F6 387 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 DSCAML1Q8TD84 2053 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 ALX3O95076 343 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 CFDP00746 253 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 PPYP01298 95 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 GNRHRP30968 328 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 CEACAM6P40199 344 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 GNG10P50151 68 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 SELENOVP59797 346 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 CCDC36Q8IYA8 594 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 MUC15Q8N387 334 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 LILRB4Q8NHJ6 448 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 ARL11Q969Q4 196 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 TP53RKQ96S44 253 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 MAGT1Q9H0U3 335 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF286AQ9HBT8 521 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 LPAR2Q9HBW0 351 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 SPEF1Q9Y4P9 236 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 FN1P02751 2386 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 C12orf77C9JDV5 145 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 SULT1A3P0DMM9 295 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 SULT1A4P0DMN0 295 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 ANXA3P12429 323 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 EPHA1P21709 976 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 SPINK9Q5DT21 86 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 KRBOX4Q5JUW0 171 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 Q9N2K0 584 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 OR2S2Q9NQN1 319 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 SLC2A9Q9NRM0 540 aa5.5□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 A0A0A6YYH2 397 aa5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 A6NJ64 397 aa5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 SULT1C2O00338 296 aa5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 TUSC2O75896 110 aa5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 NAPSAO96009 420 aa5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 KITLGP21583 273 aa5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 MPZP25189 248 aa5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 GZMKP49863 264 aa5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 DECR2Q9NUI1 292 aa5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 NDRG3Q9UGV2 375 aa5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 NSG2Q9Y328 171 aa5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 A0A1B0GUH1 482 aa5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 NAP1L6A6NFF2 107 aa5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 H3BP45 60 aa5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 CDK2AP1O14519 115 aa5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 SH2D1BO14796 132 aa5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 CD3EP07766 207 aa5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF728P0DKX0 622 aa5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 ZBTB25P24278 435 aa5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 S100A10P60903 97 aa5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 BTG1P62324 171 aa5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 ABCA11PQ4W5N1 156 aa5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 ANGPTL6Q8NI99 470 aa5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 SLC5A7Q9GZV3 580 aa5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 JKAMPQ9P055 326 aa5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 COPZ2Q9P299 210 aa5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 WIPI2Q9Y4P8 454 aa5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 C17orf100A8MU93 164 aa5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 RRASP10301 218 aa5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 REG1BP48304 166 aa5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 C15orf40Q8WUR7 153 aa5.49□□□□□ -1.53
CNIH1-201ENST00000216416 SMIM3Q9BZL3 60 aa5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms