RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-211ENST00000582232 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 WFDC11Q8NEX6 87 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 TMEM185AQ8NFB2 350 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 DIRAS2Q96HU8 199 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 DMRTB1Q96MA1 342 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 SOSTQ9BQB4 213 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 SULT4A1Q9BR01 284 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 FAAP24Q9BTP7 215 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 REG4Q9BYZ8 158 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 PPA2Q9H2U2 334 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 EXTL2Q9UBQ6 330 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 CLN8Q9UBY8 286 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP9.55□□□□□ -0.884e-7■■■□□ 17.3
GGA3-211ENST00000582232 CR1P17927 2039 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 OTOGQ6ZRI0 2925 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 TRAV18A0A075B6X5 111 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 FUOMA2VDF0 154 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 H7C1Q1 480 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 ECDO95905 644 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 HLA-DQB1P01920 261 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP9.54□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 TALDO1P37837 337 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 TAS2R20P59543 309 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 CDNFQ49AH0 187 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 ESCO2Q56NI9 601 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 NKAPLQ5M9Q1 402 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 HACD4Q5VWC8 232 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 SLC35E4Q6ICL7 350 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 CNIH2Q6PI25 160 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 ZNF497Q6ZNH5 498 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 CCDC190Q86UF4 302 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 BPIFB2Q8N4F0 458 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 OR4M1Q8NGD0 313 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 C8orf46Q8TAG6 207 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 C15orf40Q8WUR7 153 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 COQ2Q96H96 371 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 CHST6Q9GZX3 395 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 NARFLQ9H6Q4 476 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 AUNIPQ9H7T9 357 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 UBE2QL1A1L167 161 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 RNF223E7ERA6 249 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 HSPB6O14558 160 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 FOXH1O75593 365 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 NAPSAO96009 420 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 GNB3P16520 340 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 IL2RGP31785 369 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 P2RX3P56373 397 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 GNB2P62879 340 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 PITPNAQ00169 270 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 AESQ08117 197 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 CR1LQ2VPA4 569 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 CD276Q5ZPR3 534 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 BRICD5Q6PL45 260 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 GDPD3Q7L5L3 318 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 RTN4RL2Q86UN3 420 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 DCTN5Q9BTE1 182 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 ETAA1Q9NY74 926 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 LPAR3Q9UBY5 353 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 AK3Q9UIJ7 227 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-211ENST00000582232 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-211ENST00000582232 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-211ENST00000582232 CTDSPLO15194 276 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-211ENST00000582232 MT-ND4P03905 459 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-211ENST00000582232 NDUFB7P17568 137 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-211ENST00000582232 PAX2Q02962 417 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-211ENST00000582232 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
GGA3-211ENST00000582232 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.89
GGA3-211ENST00000582232 KRBOX4Q5JUW0 171 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-211ENST00000582232 SPANXN2Q5MJ10 180 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-211ENST00000582232 OLFML2AQ68BL7 652 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-211ENST00000582232 PYHIN1Q6K0P9 492 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-211ENST00000582232 ZNF880Q6PDB4 577 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-211ENST00000582232 BTN2A1Q7KYR7 527 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-211ENST00000582232 FGFRL1Q8N441 504 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-211ENST00000582232 LY6G5BQ8NDX9 201 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-211ENST00000582232 NEK7Q8TDX7 302 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-211ENST00000582232 CORO2AQ92828 525 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-211ENST00000582232 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
GGA3-211ENST00000582232 CYYR1Q96J86 154 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-211ENST00000582232 ABHD1Q96SE0 405 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-211ENST00000582232 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
GGA3-211ENST00000582232 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
GGA3-211ENST00000582232 V9GYH0 126 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-211ENST00000582232 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-211ENST00000582232 ZANQ9Y493 2812 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-211ENST00000582232 WNK2Q9Y3S1 2297 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-211ENST00000582232 ODAMA1E959 279 aa9.51□□□□□ -0.89
GGA3-211ENST00000582232 TMEM235A6NFC5 223 aa9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms