RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572043.5

CTDNEP1-207, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-207ENST00000572043 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-207ENST00000572043 ECE1P42892 770 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 PSME4Q14997 1843 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 AOC2O75106 756 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 GNAI3P08754 354 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 HUNKP57058 714 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 BCAMP50895 628 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 DLGAP5Q15398 846 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 AIDAQ96BJ3 306 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 FOXN1O15353 648 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 CFAP100Q494V2 611 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 SRGAP3O43295 1099 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC5A1P13866 664 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 FGFR2P21802 821 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 MMP14P50281 582 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 WBP1LQ9NX94 342 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 CLRN2A0PK11 232 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 CIAO1O76071 339 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 LPIN2Q92539 896 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 GNAI2P04899 355 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 GRIK5Q16478 980 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 MOB2Q70IA6 237 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 AOX1Q06278 1338 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 ATP2B3Q16720 1220 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 RGMBQ6NW40 437 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 COPRSQ9NQ92 184 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 VEZTQ9HBM0 779 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 FBXO3Q9UK99 471 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 MYO1BO43795 1136 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 SPDYE6P0CI01 402 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 RLBP1P12271 317 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 PRKG1Q13976 671 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZIC5Q96T25 663 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 MAP2K2P36507 400 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 ADORA1P30542 326 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 NF2P35240 595 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 MTX1Q13505 466 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 CRKP46108 304 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 LBX1P52954 281 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 TFCP2Q12800 502 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 NOGQ13253 232 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 TSKSQ9UJT2 592 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 TIMM10P62072 90 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 FKBP1BP68106 108 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 FZD1Q9UP38 647 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 PHKA1P46020 1223 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 PANK1Q8TE04 598 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 CCDC102AQ96A19 550 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
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