RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-223ENST00000592576 DUX4L2P0CJ85 424 aa7.65□□□□□ -1.18
EFTUD2-223ENST00000592576 DUX4L3P0CJ86 424 aa7.65□□□□□ -1.18
EFTUD2-223ENST00000592576 DUX4L4P0CJ87 422 aa7.65□□□□□ -1.18
EFTUD2-223ENST00000592576 DUX4L5P0CJ88 424 aa7.65□□□□□ -1.18
EFTUD2-223ENST00000592576 DUX4L6P0CJ89 424 aa7.65□□□□□ -1.18
EFTUD2-223ENST00000592576 DUX4L7P0CJ90 424 aa7.65□□□□□ -1.18
EFTUD2-223ENST00000592576 NAT1P18440 290 aa7.65□□□□□ -1.18
EFTUD2-223ENST00000592576 MNDAP41218 407 aa7.65□□□□□ -1.18
EFTUD2-223ENST00000592576 NR4A2P43354 598 aa7.65□□□□□ -1.18
EFTUD2-223ENST00000592576 PYHIN1Q6K0P9 492 aa7.65□□□□□ -1.18
EFTUD2-223ENST00000592576 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
EFTUD2-223ENST00000592576 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
EFTUD2-223ENST00000592576 ZNRF1Q8ND25 227 aa7.65□□□□□ -1.18
EFTUD2-223ENST00000592576 DYRK2Q92630 601 aa7.65□□□□□ -1.18
EFTUD2-223ENST00000592576 TMEM246Q9BRR3 403 aa7.65□□□□□ -1.18
EFTUD2-223ENST00000592576 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
EFTUD2-223ENST00000592576 CHST6Q9GZX3 395 aa7.65□□□□□ -1.18
EFTUD2-223ENST00000592576 DUX4Q9UBX2 424 aa7.65□□□□□ -1.18
EFTUD2-223ENST00000592576 HSF4Q9ULV5 492 aa7.65□□□□□ -1.18
EFTUD2-223ENST00000592576 MAB21L2Q9Y586 359 aa7.65□□□□□ -1.18
EFTUD2-223ENST00000592576 UBE2QL1A1L167 161 aa7.65□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 MEIOCA2RUB1 952 aa7.65□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 TMPRSS2O15393 492 aa7.65□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 IGHV2-70P01814 119 aa7.65□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 SELLP14151 372 aa7.65□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 LMO1P25800 156 aa7.65□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 PYDC2Q56P42 97 aa7.65□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 C17orf107Q6ZR85 190 aa7.65□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 ST8SIA4Q92187 359 aa7.65□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 TIMD4Q96H15 378 aa7.65□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 GSX2Q9BZM3 304 aa7.65□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 PPA2Q9H2U2 334 aa7.65□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 TMEM82A0PJX8 343 aa7.64□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 J3QRK9 145 aa7.64□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 ZNF737O75373 536 aa7.64□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 PAX1P15863 534 aa7.64□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 MDH2P40926 338 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa7.64□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 Q6ZNX1 250 aa7.64□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 FAM216BQ8N7L0 139 aa7.64□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 NEK7Q8TDX7 302 aa7.64□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa7.64□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 RAB1CQ92928 201 aa7.64□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 ARPC5LQ9BPX5 153 aa7.64□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 SRRQ9GZT4 340 aa7.64□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 ING3Q9NXR8 418 aa7.64□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa7.64□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 MCRIP1C9JLW8 97 aa7.64□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 H3BUI4 141 aa7.64□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 DNASE1P24855 282 aa7.64□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 GUCA2AQ02747 115 aa7.64□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 HACD4Q5VWC8 232 aa7.64□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 LYPD2Q6UXB3 125 aa7.64□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 ZNF788Q6ZQV5 615 aa7.64□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 SDSLQ96GA7 329 aa7.64□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 SHARPINQ9H0F6 387 aa7.64□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 AK3Q9UIJ7 227 aa7.64□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 EDARQ9UNE0 448 aa7.64□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa7.64□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 SERPINE3A8MV23 424 aa7.63□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 FSTL3O95633 263 aa7.63□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 MELTFP08582 738 aa7.63□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 PRSS3P35030 304 aa7.63□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 DGCR2P98153 550 aa7.63□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 PITPNAQ00169 270 aa7.63□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 ZNF846Q147U1 533 aa7.63□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 KCNJ8Q15842 424 aa7.63□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 DCDC5Q6ZRR9 648 aa7.63□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 Q8N402 240 aa7.63□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 OR4S1Q8NGB4 309 aa7.63□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 GAFA1Q96PS6 74 aa7.63□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 NARFLQ9H6Q4 476 aa7.63□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 ZNF665Q9H7R5 613 aa7.63□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP7.63□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 CREBBPQ92793 2442 aa7.63□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 MEIS3P1A6NDR6 274 aa7.63□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 ADAM20O43506 726 aa7.63□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 TPPPO94811 219 aa7.63□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP7.63□□□□□ -1.198e-9■■■■□ 23.1
EFTUD2-223ENST00000592576 OR3A1P47881 315 aa7.63□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 IL13RA1P78552 427 aa7.63□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 ARFRP1Q13795 201 aa7.63□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 ARL6IP1Q15041 203 aa7.63□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 ZNF561Q8N587 486 aa7.63□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 OR52I2Q8NH67 350 aa7.63□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 BPESC1Q9GZL8 116 aa7.63□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
EFTUD2-223ENST00000592576 CEACAM18A8MTB9 384 aa7.63□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms