RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519651.5

TSNARE1-204, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSNARE1, Length 2,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF44P15621 663 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-204ENST00000519651 RPS2P15880 293 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-204ENST00000519651 SERPINF1P36955 418 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-204ENST00000519651 GLP1RP43220 463 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-204ENST00000519651 ANKRD55Q3KP44 614 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-204ENST00000519651 IGSF11Q5DX21 431 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-204ENST00000519651 GSG1LQ6UXU4 331 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-204ENST00000519651 FAM169BQ8N8A8 192 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-204ENST00000519651 LILRB4Q8NHJ6 448 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-204ENST00000519651 RHOFQ9HBH0 211 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-204ENST00000519651 Q9N2K0 584 aa14.9□□□□□ -0.02
TSNARE1-204ENST00000519651 ESPL1Q14674 2120 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 DEGS1O15121 323 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF728P0DKX0 622 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 BMP5P22003 454 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF83P51522 516 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 TDGF1P3P51864 188 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF546Q86UE3 836 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 DOLPP1Q86YN1 238 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 SGPP2Q8IWX5 399 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 Q8IYB0 196 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 OR5T2Q8NGG2 359 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 MUCL1Q96DR8 90 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 DHRS9Q9BPW9 319 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 TRAV24A0A0B4J272 114 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 A0A0B4J2A0 478 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 TMEM210A6NLX4 147 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 M0R1B8 84 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 MLNRO43193 412 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 S100A11P31949 105 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 NAAAQ02083 359 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 TMUB2Q71RG4 321 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 ARL6Q9H0F7 186 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 SHPKQ9UHJ6 478 aa14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 ADAP1O75689 374 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 NXPH2O95156 264 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 IFNA2P01563 188 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 PIGPP57054 158 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 C11orf87Q6NUJ2 197 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 Q6ZS49 121 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 C5orf24Q7Z6I8 188 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 FAM210AQ96ND0 272 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 MFFQ9GZY8 342 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 RAB18Q9NP72 206 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 CEP295Q9C0D2 2601 aa14.88□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 SCTP09683 121 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 PGA5P0DJD9 388 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 KITLGP21583 273 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 ERVK11-1P61568 191 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 ABCA11PQ4W5N1 156 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 GFRALQ6UXV0 394 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 C1orf174Q8IYL3 243 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 OR8H3Q8N146 312 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 MSL2Q9HCI7 577 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 RDH8Q9NYR8 311 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 A8MXE2 369 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 BET1O15155 118 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 IFNA7P01567 189 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 RBMXP38159 391 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 HERV-K104P61576 105 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 FAM27E3Q08E93 113 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 CXXC4Q9H2H0 198 aa14.87□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 CFDP00746 253 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 GLAP06280 429 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 FAM87AP0C7U9 286 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 RPA2P15927 270 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 AADACP22760 399 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 CYCSP99999 105 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 Q6P435 159 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 C20orf204Q6ZNR8 217 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 MOB3AQ96BX8 217 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 NRIP2Q9BQI9 281 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 C1orf123Q9NWV4 160 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 ATP23Q9Y6H3 246 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 MPTX1A8MV57 137 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 TRDCB7Z8K6 153 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 CRYAAP02489 173 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 TK1P04183 234 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 HOXB5P09067 269 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 KIR2DS4P43632 304 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 KIR2DS1Q14954 304 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 TMEM65Q6PI78 240 aa14.86□□□□□ -0.03
TSNARE1-204ENST00000519651 Q6ZR03 302 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms