RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 OCSTAMPQ9BR26 566 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC30A6NM36 301 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 Q6P435 159 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-206ENST00000588815 DSCAMO60469 2012 aa26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 MCRIP1C9JLW8 97 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 DEGS1O15121 323 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 LYRM1O43325 122 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 DANCRP0C864 163 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 OLFML2AQ68BL7 652 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 SULT4A1Q9BR01 284 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 FAAP24Q9BTP7 215 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 IFT46Q9NQC8 304 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 ANAPC10Q9UM13 185 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 CACNG2Q9Y698 323 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 SSX5O60225 188 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 C11orf71Q6IPW1 123 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 C1orf87Q8N0U7 546 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM229BQ8NBD8 167 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR13Q9H1Z4 485 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 NAP1L6A6NFF2 107 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 WNT9BO14905 357 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 PLA2G2AP14555 144 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF44P15621 663 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 LMO1P25800 156 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 DUSP1P28562 367 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 FAUP35544 74 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 TAS2R19P59542 299 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 OXA1LQ15070 435 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 RTN4RL2Q86UN3 420 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 CHST6Q9GZX3 395 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF581Q9P0T4 197 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 J3QKU1 62 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 HAND1O96004 215 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 DTYMKP23919 212 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 PDCD1Q15116 288 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM16LQ309B1 348 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 SHEQ5VZ18 495 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB1BQ9H0U4 201 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 TREM2Q9NZC2 230 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 NLKQ9UBE8 527 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 DNAJB11Q9UBS4 358 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 AK3Q9UIJ7 227 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 MEIS3P1A6NDR6 274 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2H2O95918 312 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 NAT1P18440 290 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 MDH2P40926 338 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 SUMF2Q8NBJ7 301 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 EDARQ9UNE0 448 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAV24A0A0B4J272 114 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PPR1 153 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 POM121CA8CG34 1229 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 EGR1P18146 543 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 TBPP20226 339 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 GMFBP60983 142 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 TLE4Q04727 773 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 CD8AP01732 235 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 AKAIN1P0CW23 69 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 C12orf4Q9NQ89 552 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 WIPI2Q9Y4P8 454 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNJ3P48549 501 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 HOGA1Q86XE5 327 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 OR14J1Q9UGF5 321 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 UBE2QL1A1L167 161 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2AT4A6NND4 320 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 SOD3P08294 240 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 TEX36Q5VZQ5 186 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 DCDC5Q6ZRR9 648 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 CENPSQ8N2Z9 138 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 NEK7Q8TDX7 302 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 HRASLSQ9HDD0 168 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 RFPL4AA6NLU0 287 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 H7C1Q1 480 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 CD74P04233 296 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 PSG2P11465 335 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 MICBQ29980 383 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 ACTBL2Q562R1 376 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 STEAP1BQ6NZ63 245 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 GDPD3Q7L5L3 318 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 GVQW1Q8N7I0 195 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 ENKURQ8TC29 256 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-206ENST00000588815 RDH5Q92781 318 aa26.05■■□□□ 1.76
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