RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578896.1

GGA3-207, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 5

Gene GGA3, Length 439 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-207ENST00000578896 IGHV3-7P01780 117 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 RBP4P02753 201 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 LPLP06858 475 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 ZNF20P17024 532 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 CD33P20138 364 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 HTR1DP28221 377 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 RBP2P50120 134 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 DYNLT3P51808 116 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 P2RX3P56373 397 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 LOXL3P58215 753 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 ISL1P61371 349 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 CD83Q01151 205 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 COL7A1Q02388 2944 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 PDZK1IP1Q13113 114 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 ZNF146Q15072 292 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 ABCA11PQ4W5N1 156 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 C9orf152Q5JTZ5 239 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 MINOS1Q5TGZ0 78 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 C1orf146Q5VVC0 180 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 OR13C9Q8NGT0 318 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 STMN2Q93045 179 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 RNFT2Q96EX2 444 aa7.14□□□□□ -1.27
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GGA3-207ENST00000578896 HMG20AQ9NP66 347 aa7.14□□□□□ -1.27
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GGA3-207ENST00000578896 FRRS1LQ9P0K9 344 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 DPM3Q9P2X0 92 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 OAZ3Q9UMX2 235 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 J3QLW9 94 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 HSPB6O14558 160 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 CYB5AP00167 134 aa7.13□□□□□ -1.27
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GGA3-207ENST00000578896 PF4V1P10720 104 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 ZNF44P15621 663 aa7.13□□□□□ -1.27
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GGA3-207ENST00000578896 NFYBP25208 207 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 BNIP1Q12981 228 aa7.13□□□□□ -1.27
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GGA3-207ENST00000578896 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
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GGA3-207ENST00000578896 TMEM244Q5VVB8 128 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 Q6P435 159 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 FAM220AQ7Z4H9 259 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 ENTHD1Q8IYW4 607 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 DTX3Q8N9I9 347 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 DNAAF1Q8NEP3 725 aa7.13□□□□□ -1.27
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GGA3-207ENST00000578896 COQ2Q96H96 371 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 OPALINQ96PE5 141 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
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GGA3-207ENST00000578896 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
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GGA3-207ENST00000578896 TRAV39A0A0B4J263 110 aa7.12□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 DAPL1A0PJW8 107 aa7.12□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 K7EIL1 84 aa7.12□□□□□ -1.27
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GGA3-207ENST00000578896 AMY2AP04746 511 aa7.12□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 HTR1AP08908 422 aa7.12□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 OCM2P0CE71 109 aa7.12□□□□□ -1.27
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GGA3-207ENST00000578896 PRKACBP22694 351 aa7.12□□□□□ -1.27
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GGA3-207ENST00000578896 OR3A4PP47883 348 aa7.12□□□□□ -1.27
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GGA3-207ENST00000578896 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa7.12□□□□□ -1.27
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GGA3-207ENST00000578896 HEPN1Q6WQI6 88 aa7.12□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.12□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa7.12□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 UTS2BQ765I0 119 aa7.12□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 REC114Q7Z4M0 266 aa7.12□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 LHFPL3Q86UP9 236 aa7.12□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 Q8IYB0 196 aa7.12□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 WFDC9Q8NEX5 89 aa7.12□□□□□ -1.27
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GGA3-207ENST00000578896 CAPSLQ8WWF8 208 aa7.12□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 PYDC1Q8WXC3 89 aa7.12□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 C4orf36Q96KX1 117 aa7.12□□□□□ -1.27
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GGA3-207ENST00000578896 OSBPL10Q9BXB5 764 aa7.12□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 GLS2Q9UI32 602 aa7.12□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa7.11□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 ODAMA1E959 279 aa7.11□□□□□ -1.27
GGA3-207ENST00000578896 OR4C45A6NMZ5 311 aa7.11□□□□□ -1.27
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