RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557667.5

RBM23-233, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 1 (best)

Gene RBM23, Length 4,240 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-233	ENST00000557667	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF266	Q14584	549 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667		A6NLC8	198 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	RAMP1	O60894	148 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	ADH4	P08319	380 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	HTR2B	P41595	481 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	HLA-DRB3	P79483	266 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	SUN5	Q8TC36	379 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667		M0QYG6	137 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	SSX5	O60225	188 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	PMP2	P02689	132 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	CFHR2	P36980	270 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	VAMP2	P63027	116 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	SLC22A25	Q6T423	547 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	TAAR6	Q96RI8	345 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667		Q9N2K0	584 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667		A0A0G2JMM0	328 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667		A0A1W2PPB8	328 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667		A0A1W2PRS3	328 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	ADRB1	P08588	477 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	AKR1C4	P17516	323 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	TAS2R30	P59541	319 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	ARL11	Q969Q4	196 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	LURAP1	Q96LR2	239 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	IL17B	Q9UHF5	180 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	VSIG4	Q9Y279	399 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667		A0A1B0GWJ7	208 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667		A0A1W2PPH5	198 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	PINLYP	A6NC86	204 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	OOEP	A6NGQ2	149 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667		H0Y980	276 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	SOCS1	O15524	211 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	IRF2	P14316	349 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	RAB7A	P51149	207 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	MIDN	Q504T8	468 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	BRICD5	Q6PL45	260 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	OR8H3	Q8N146	312 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	UMAD1	C9J7I0	102 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF695	Q8IW36	515 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	NUP37	Q8NFH4	326 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	NPAS1	Q99742	590 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	AK3	Q9UIJ7	227 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667		A0A1B0GU03	582 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	LRRC30	A6NM36	301 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	TRIM77	I1YAP6	450 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	CRYAA	P02489	173 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	OPN1LW	P04000	364 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	UCP2	P55851	309 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	PPP1R1A	Q13522	171 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	MDP1	Q86V88	176 aa		7.31	□□□□□ -1.24

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