RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557549.5

RBM23-231, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-231	ENST00000557549	GPR176	Q14439	515 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-231	ENST00000557549	IL13RA2	Q14627	380 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-231	ENST00000557549	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-231	ENST00000557549	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-231	ENST00000557549	GPR157	Q5UAW9	335 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-231	ENST00000557549	SATL1	Q86VE3	508 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-231	ENST00000557549	OR8H2	Q8N162	312 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-231	ENST00000557549	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-231	ENST00000557549	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-231	ENST00000557549	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-231	ENST00000557549	FCGR1B	Q92637	280 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-231	ENST00000557549	S100A13	Q99584	98 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-231	ENST00000557549	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-231	ENST00000557549	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-231	ENST00000557549	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-231	ENST00000557549	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-231	ENST00000557549	NOX4	Q9NPH5	578 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-231	ENST00000557549	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-231	ENST00000557549	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549		A0A1W2PPE2	198 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549		A0A1W2PQ09	198 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549		A0A1W2PR64	198 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549		A0A1W2PRV1	198 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	FUOM	A2VDF0	154 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	PIN1P1	O15428	100 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	SFTPB	P07988	381 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	HSMCR30	P0CW71	290 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	RANBP1	P43487	201 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	ARF6	P62330	175 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	GUCA2A	Q02747	115 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	RSU1	Q15404	277 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	LINC00596	Q86U02	117 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	BATF2	Q8N1L9	274 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	DUX5	Q96PT3	197 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	METTL9	Q9H1A3	318 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	GHRL	Q9UBU3	117 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	MGST3	O14880	152 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	ARL6IP5	O75915	188 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	INMT	O95050	263 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	RBP4	P02753	201 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	CSN2	P05814	226 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	UCHL1	P09936	223 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	GAL	P22466	123 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	PRTN3	P24158	256 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	GABRA5	P31644	462 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	RNF144B	Q7Z419	303 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	LYPD6	Q86Y78	171 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	TBX15	Q96SF7	602 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	TMED9	Q9BVK6	235 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	SLITRK2	Q9H156	845 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	IFT22	Q9H7X7	185 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	FBN3	Q75N90	2809 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549		A0A1W2PPK0	400 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM82	A0PJX8	343 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM89	A2RUT3	159 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549		H3BUI4	141 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	OR2H2	O95918	312 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	CD37	P11049	281 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	SRM	P19623	302 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	MAP2K4	P45985	399 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	OR3A4P	P47883	348 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	KCNJ3	P48549	501 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	ACTG1	P63261	375 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	BAMBI	Q13145	260 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	GRK1	Q15835	563 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	MPV17L	Q2QL34	196 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBM23-231	ENST00000557549	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		10.12	□□□□□ -0.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms