RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481037.5

RBM39-232, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 687 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-232ENST00000481037 PIPP12273 146 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 SDC1P18827 310 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 BMI1P35226 326 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 OPRL1P41146 370 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 RPL31P62899 125 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 CBX1P83916 185 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 CD47Q08722 323 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 CALCOCO2Q13137 446 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 HES1Q14469 280 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 SYPL1Q16563 259 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 MINOS1Q5TGZ0 78 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 FAM27BQ5VT28 67 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 C5orf46Q6UWT4 87 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 ZNF767PQ75MW2 155 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 CPLX4Q7Z7G2 160 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 PGAM4Q8N0Y7 254 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 OR5J2Q8NH18 312 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 TCP10LQ8TDR4 215 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 CDKL2Q92772 493 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 TMEM106AQ96A25 262 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 SLCO4A1Q96BD0 722 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 GON7Q9BXV9 100 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 TXNIPQ9H3M7 391 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 VSIG4Q9Y279 399 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa4□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 A0A0G2JLM5 398 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 IZUMO1RA6ND01 250 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 C12orf71A8MTZ7 269 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 OR11H12B2RN74 326 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 LGALS9O00182 355 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 SIGLEC5O15389 551 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 GMDSO60547 372 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 IGHG2P01859 326 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 CD7P09564 240 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 ZNF823P16415 610 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 CTRB1P17538 263 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 HTR1DP28221 377 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 SSTR1P30872 391 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 HPCAL1P37235 193 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 ARHGDIBP52566 201 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 XGP55808 180 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 ACTA2P62736 377 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 ACTG2P63267 376 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 CSNK2BP67870 215 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 ACTC1P68032 377 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 ACTA1P68133 377 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 HBA1P69905 142 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 ZNF273Q14593 569 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 PPP1R7Q15435 360 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 HIST3H3Q16695 136 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 DEFB135Q30KP9 77 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 C10orf128Q5T292 105 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 GRTP1Q5TC63 336 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 CTRB2Q6GPI1 263 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 NANOGP8Q6NSW7 305 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 ZYG11AQ6WRX3 759 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 C10orf107Q8IVU9 208 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 NKAIN4Q8IVV8 208 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 PEX5LQ8IYB4 626 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 C5orf56Q8N8D9 126 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 ZNF491Q8N8L2 437 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 OR11H6Q8NGC7 330 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 OR52P1PQ8NH57 321 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 PSMA8Q8TAA3 256 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 UBE2E2Q96LR5 201 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 MFFQ9GZY8 342 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 SLC38A1Q9H2H9 487 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 TMCO1Q9UM00 188 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 ANGPT4Q9Y264 503 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 WSB1Q9Y6I7 421 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 DSCAML1Q8TD84 2053 aa3.99□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 A8MT66 165 aa3.98□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 CDIPTO14735 213 aa3.98□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 IFNA10P01566 189 aa3.98□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 TPM3P06753 285 aa3.98□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 GUSBP08236 651 aa3.98□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 RBP1P09455 135 aa3.98□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 P0DMU3 169 aa3.98□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 FAM231AP0DMU4 169 aa3.98□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 FAM231CP0DMU5 169 aa3.98□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 COX5BP10606 129 aa3.98□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 TMEM11P17152 192 aa3.98□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 VDAC1P21796 283 aa3.98□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 BGNP21810 368 aa3.98□□□□□ -1.77
RBM39-232ENST00000481037 MDH1P40925 334 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms