RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 F8VWA3 439 aa12.74□□□□□ -0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 SH2D1BO14796 132 aa12.74□□□□□ -0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 HAND1O96004 215 aa12.74□□□□□ -0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 DUX4L2P0CJ85 424 aa12.74□□□□□ -0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 DUX4L3P0CJ86 424 aa12.74□□□□□ -0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 DUX4L4P0CJ87 422 aa12.74□□□□□ -0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 DUX4L5P0CJ88 424 aa12.74□□□□□ -0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 DUX4L6P0CJ89 424 aa12.74□□□□□ -0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 DUX4L7P0CJ90 424 aa12.74□□□□□ -0.37
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PGGT1B-202ENST00000379615 METTL11BQ5VVY1 283 aa12.74□□□□□ -0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa12.74□□□□□ -0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 CEACAM19Q7Z692 300 aa12.74□□□□□ -0.37
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PGGT1B-202ENST00000379615 FAM192AQ9GZU8 254 aa12.74□□□□□ -0.37
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PGGT1B-202ENST00000379615 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
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PGGT1B-202ENST00000379615 KIR3DL3Q8N743 410 aa12.72□□□□□ -0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 CHST4Q8NCG5 386 aa12.72□□□□□ -0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 ORAI1Q96D31 301 aa12.72□□□□□ -0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 NUP50Q9UKX7 468 aa12.72□□□□□ -0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 FCN3O75636 299 aa12.71□□□□□ -0.37
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PGGT1B-202ENST00000379615 RNF144BQ7Z419 303 aa12.71□□□□□ -0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 OR8H2Q8N162 312 aa12.71□□□□□ -0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 WDFY2Q96P53 400 aa12.71□□□□□ -0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 UQCC2Q9BRT2 126 aa12.71□□□□□ -0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 PCGF1Q9BSM1 259 aa12.71□□□□□ -0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 IL36GQ9NZH8 169 aa12.71□□□□□ -0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 ONECUT1Q9UBC0 465 aa12.71□□□□□ -0.37
PGGT1B-202ENST00000379615 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa12.7□□□□□ -0.38
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1W2PPE2 198 aa12.7□□□□□ -0.38
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