RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		15.98	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	FBXL17	Q9UF56	701 aa		15.98	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		15.98	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559		B4E171	279 aa		15.97	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	MSTN	O14793	375 aa		15.97	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	XRCC2	O43543	280 aa		15.97	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	TCN2	P20062	427 aa		15.97	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	TSPAN7	P41732	249 aa		15.97	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	LPAR6	P43657	344 aa		15.97	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	RGS19	P49795	217 aa		15.97	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	UCP3	P55916	312 aa		15.97	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM33	P57088	247 aa		15.97	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	MALL	Q13021	153 aa		15.97	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM187	Q14656	261 aa		15.97	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		15.97	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		15.97	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	OR10D3	Q8NH80	312 aa		15.97	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	ADGRG7	Q96K78	797 aa		15.97	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		15.97	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	LIME1	Q9H400	295 aa		15.97	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		15.97	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	ARID1A	O14497	2285 aa		15.97	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		15.97	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	NRN1L	Q496H8	165 aa		15.97	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	FAM219A	Q8IW50	185 aa		15.97	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		15.97	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0G2JMM0	328 aa		15.96	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PPB8	328 aa		15.96	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PRS3	328 aa		15.96	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		15.96	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		15.96	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	PDCD6	O75340	191 aa		15.96	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	15.96	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	NME2	P22392	152 aa		15.96	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	GLP1R	P43220	463 aa		15.96	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		15.96	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	PIGY	Q3MUY2	71 aa		15.96	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	GPR157	Q5UAW9	335 aa		15.96	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		15.96	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		15.96	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	BTNL8	Q6UX41	500 aa		15.96	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		15.96	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	GPR35	Q9HC97	309 aa		15.96	■□□□□ 0.15
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559		H7C1Q1	480 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	TRAPPC6A	O75865	159 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV1D-12	P01611	117 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	OR5AC1	P0C628	307 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	15.95	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF92	Q03936	586 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	HFE	Q30201	348 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	SLC22A25	Q6T423	547 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	LGI3	Q8N145	548 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	MOB3A	Q96BX8	217 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	15.95	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	MLX	Q9UH92	298 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	15.95	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	NDUFA2	O43678	99 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	CYTIP	O60759	359 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	SCGB1D2	O95969	90 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	CD5	P06127	495 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	HEXA	P06865	529 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	PATE4	P0C8F1	98 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	OTX2	P32243	289 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	ACER2	Q5QJU3	275 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	15.95	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	SPSB4	Q96A44	273 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	PRO3102	Q9H379	93 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	TCFL5	Q9UL49	500 aa		15.95	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		15.94	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	LINC01387	J3KSC0	135 aa		15.94	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	FBXO24	O75426	580 aa		15.94	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	15.94	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	FUT3	P21217	361 aa		15.94	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	DUSP1	P28562	367 aa		15.94	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	15.94	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	FXYD4	P59646	89 aa		15.94	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		15.94	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		15.94	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	C18orf12	Q96KH6	178 aa		15.94	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		15.94	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		15.94	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		15.94	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		15.94	■□□□□ 0.14
RRN3-205	ENST00000563559	TDGF1	P13385	188 aa		15.94	■□□□□ 0.14

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