RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484031.5

TRO-222, Transcript of trophinin, human

TSL 5

Gene TRO, Length 650 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRO-222	ENST00000484031	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031		E9PI62	339 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	AKR7A2	O43488	359 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	ADAM20	O43506	726 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	SYT7	O43581	403 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	NRAS	P01111	189 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	ATP6V1B1	P15313	513 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	RAB40B	Q12829	278 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	GALE	Q14376	348 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	SETD9	Q8NE22	299 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	TECTB	Q96PL2	329 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	ZNF649	Q9BS31	505 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	VCX	Q9H320	206 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	ABCB9	Q9NP78	766 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	TMEM210	A6NLX4	147 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031		H0YHG0	523 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	FCN3	O75636	299 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	LIMS3	P0CW19	117 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	LIMS4	P0CW20	117 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	SELL	P14151	372 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	ETV1	P50549	477 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	ARF6	P62330	175 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	GNG3	P63215	75 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	TMEM42	Q69YG0	159 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	RNF144B	Q7Z419	303 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	ZNF488	Q96MN9	340 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	OR5B21	A6NL26	309 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	SYNGR1	O43759	233 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	LHB	P01229	141 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	SLC35A2	P78381	396 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	XAF1	Q6GPH4	301 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	CCL13	Q99616	98 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	OR51I2	Q9H344	312 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	MEGF11	A6BM72	1044 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031		H0YAE9	185 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	ZNF20	P17024	532 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	HAAO	P46952	286 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	IL18R1	Q13478	541 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	UBE2V2	Q15819	145 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	STUM	Q69YW2	141 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031		Q6ZSR3	168 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	AHSA2	Q719I0	299 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	KRT74	Q7RTS7	529 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	SYS1	Q8N2H4	156 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	ST8SIA4	Q92187	359 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	AQP3	Q92482	292 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TRO-222	ENST00000484031	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		10.6	□□□□□ -0.71

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