RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 A0A1B0GTQ1 180 aa9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 ORM1P02763 201 aa9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 DLEU7Q6UYE1 221 aa9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 MCHR2Q969V1 340 aa9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 NRTNQ99748 197 aa9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 OR4A8P0C604 315 aa9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 HTR1DP28221 377 aa9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 AVPR2P30518 371 aa9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 SULT1A2P50226 295 aa9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 UBTD2Q8WUN7 234 aa9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 CCL21O00585 134 aa9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 VAMP5O95183 116 aa9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 ACSM4P0C7M7 580 aa9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 GCSHP23434 173 aa9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 TPBGQ13641 420 aa9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 OR52L2PQ8NGH6 319 aa9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 CT55Q8WUE5 264 aa9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 ST8SIA1Q92185 356 aa9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 TMEM56Q96MV1 263 aa9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 GON7Q9BXV9 100 aa9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 SPNS1Q9H2V7 528 aa9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 NRAPQ86VF7 1730 aa9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 LPAR6P43657 344 aa9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 CCR5P51681 352 aa9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 GGTLC2Q14390 218 aa9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 OR5R1Q8NH85 324 aa9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 C5orf52A6NGY3 159 aa9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 CD3EP07766 207 aa9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 CALCRP30988 508 aa9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 MAGEA5P43359 124 aa9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 TCL1AP56279 114 aa9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 GPNMBQ14956 572 aa9.44□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 M0R296 226 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 GUCA2BQ16661 112 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 ANKRD37Q7Z713 158 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 SRD5A3Q9H8P0 318 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 OCIAD1Q9NX40 245 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 MTCH2Q9Y6C9 303 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 DOCK1Q14185 1865 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 TRAV17A0A0B4J275 112 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 LMO7DNF2Z398 122 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 SP1P08047 785 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 GIPP09681 153 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 ZNF32P17041 273 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 CHRNA7P36544 502 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 ERVS71-1P61550 626 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 C19orf35Q6ZS72 473 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 LFNGQ8NES3 379 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 OR4C16Q8NGL9 310 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 C4orf45Q96LM5 186 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 B9D1Q9UPM9 204 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 ST8SIA5O15466 376 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 TGOLN2O43493 480 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 GNG4P50150 75 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 TAS2R60P59551 318 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 HIST1H3AP68431 136 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 OR5A2Q8NGI9 324 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 OR2G2Q8NGZ5 317 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 CXorf58Q96LI9 332 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 PRDM14Q9GZV8 571 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 OR5V1Q9UGF6 321 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 NAT8BQ9UHF3 227 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 IL17BQ9UHF5 180 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 OR4C46A6NHA9 309 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 ACP1P24666 158 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 GNG3P63215 75 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 MIDNQ504T8 468 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 SPEM1Q8N4L4 309 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 AMER3Q8N944 861 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 TMEM204Q9BSN7 226 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 TRIM77I1YAP6 450 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 DHHO43323 396 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 GPX5O75715 221 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 MBP02144 154 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 YBX1P67809 324 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 CRYGNQ8WXF5 182 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 RND1Q92730 232 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 SMIM19Q96E16 107 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 RHNO1Q9BSD3 238 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 VAMP8Q9BV40 100 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 SERPINE3A8MV23 424 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 GPR3P46089 330 aa9.43□□□□□ -0.9
CLN8-201ENST00000331222 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms