RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273317.4

LIMD1-201, Transcript of LIM domains containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMD1, Length 11,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-201ENST00000273317 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
LIMD1-201ENST00000273317 IGLV3-25P01717 112 aa7.17□□□□□ -1.26
LIMD1-201ENST00000273317 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
LIMD1-201ENST00000273317 ETV3LQ6ZN32 361 aa7.17□□□□□ -1.26
LIMD1-201ENST00000273317 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
LIMD1-201ENST00000273317 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
LIMD1-201ENST00000273317 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa7.17□□□□□ -1.26
LIMD1-201ENST00000273317 Q7L0L9 218 aa7.17□□□□□ -1.26
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LIMD1-201ENST00000273317 A0A087WUJ7 227 aa7.16□□□□□ -1.26
LIMD1-201ENST00000273317 B4GALT3O60512 393 aa7.16□□□□□ -1.26
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LIMD1-201ENST00000273317 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
LIMD1-201ENST00000273317 ASB16Q96NS5 453 aa7.15□□□□□ -1.26
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LIMD1-201ENST00000273317 SLC22A13Q9Y226 551 aa7.15□□□□□ -1.26
LIMD1-201ENST00000273317 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
LIMD1-201ENST00000273317 POU2F2P09086 479 aa7.15□□□□□ -1.26
LIMD1-201ENST00000273317 FAHP16930 419 aa7.15□□□□□ -1.26
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