RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
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PTPRU-204ENST00000428026 C5orf67F2Z3F1 127 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRU-204ENST00000428026 GPR37O15354 613 aa12.99□□□□□ -0.33
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PTPRU-204ENST00000428026 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
PTPRU-204ENST00000428026 OTOSQ8NHW6 89 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRU-204ENST00000428026 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRU-204ENST00000428026 SLC35B3Q9H1N7 401 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRU-204ENST00000428026 SMOC1Q9H4F8 434 aa12.99□□□□□ -0.33
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