RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539921.5

SNHG1-211, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG1, Length 1,071 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG1-211ENST00000539921 GUCD1Q96NT3 240 aa5.46□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 GPA33Q99795 319 aa5.46□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 ALG12Q9BV10 488 aa5.46□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 ABHD6Q9BV23 337 aa5.46□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa5.46□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 OR52D1Q9H346 318 aa5.46□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 BANF2Q9H503 90 aa5.46□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 EGLN3Q9H6Z9 239 aa5.46□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 SPANXA1Q9NS26 97 aa5.46□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 CLEC5AQ9NY25 188 aa5.46□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF319Q9P2F9 582 aa5.46□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 CLN8Q9UBY8 286 aa5.46□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 FBXL17Q9UF56 701 aa5.46□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 IL36AQ9UHA7 158 aa5.46□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 ANAPC10Q9UM13 185 aa5.46□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 ICAM5Q9UMF0 924 aa5.46□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 NPIPA1Q9UND3 350 aa5.46□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 SH2B3Q9UQQ2 575 aa5.46□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 VSIG4Q9Y279 399 aa5.46□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 GPR52Q9Y2T5 361 aa5.46□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa5.46□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 OR51B2Q9Y5P1 312 aa5.46□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 ARL5AQ9Y689 179 aa5.46□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 FRMPD3Q5JV73 1810 aa5.46□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 TSPAN11A1L157 253 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 OR4C45A6NMZ5 311 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 HIDE1A8MVS5 230 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 OR11H12B2RN74 326 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 E5RGE8 158 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 G3V4G9 280 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 H0YL77 283 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 J3QLW9 94 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 SCDO00767 359 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 PIN1P1O15428 100 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 FCMRO60667 390 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 LEFTY1O75610 366 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 DEDDO75618 318 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 RHBDL1O75783 438 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 STK17BO94768 372 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 VAMP5O95183 116 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 TXNDC12O95881 172 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 THY1P04216 161 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 PCCBP05166 539 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 IGLC2P0DOY2 106 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 IGLC3P0DOY3 106 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 CEACAM1P13688 526 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 CD99P14209 185 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 AKR1C4P17516 323 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 AOAHP28039 575 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 VIPR2P41587 438 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 LGALS7P47929 136 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 SLC6A8P48029 635 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 CSNK1A1P48729 337 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 RAE1P78406 368 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 CCL7P80098 99 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 HYAL1Q12794 435 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF154Q13106 437 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 SLAQ13239 276 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF266Q14584 549 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 UPP1Q16831 310 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 SLC22A6Q4U2R8 563 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 RNFT1Q5M7Z0 435 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 VAX1Q5SQQ9 334 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 C9orf50Q5SZB4 431 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 FAM166AQ6J272 317 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 SLC8B1Q6J4K2 584 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF343Q6P1L6 599 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 HOGA1Q86XE5 327 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF584Q8IVC4 421 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF595Q8IYB9 648 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 C1orf174Q8IYL3 243 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 OR2L13Q8N349 312 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 STPG4Q8N801 248 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 OR11H1Q8NG94 326 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 OR4N2Q8NGD1 307 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 OR52M1Q8NGK5 317 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 OR11H2Q8NH07 326 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF563Q8TA94 476 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 SUSD6Q92537 303 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 MRGPRFQ96AM1 343 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 ANAPC16Q96DE5 110 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 WDR34Q96EX3 536 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 ABHD14BQ96IU4 210 aa5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
SNHG1-211ENST00000539921 OR10C1Q96KK4 312 aa5.45□□□□□ -1.54
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