RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000347055.3

KRCC1-201, Transcript of lysine rich coiled-coil 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KRCC1, Length 1,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1-201ENST00000347055 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 ZNF878C9JN71 531 aa16.1■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 C9JQL5 133 aa16.1■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 IGHV2-70P01814 119 aa16.1■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 DANCRP0C864 163 aa16.1■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 FCGR2CP31995 323 aa16.1■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 OR2I1PQ8NGU4 316 aa16.1■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 SSC4DQ8WTU2 575 aa16.1■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 MRGPRX1Q96LB2 322 aa16.1■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 OR10A2Q9H208 303 aa16.1■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 CHST11Q9NPF2 352 aa16.1■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 GPR27Q9NS67 375 aa16.1■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 SOCS1O15524 211 aa16.09■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 OR8U9P0C7N5 309 aa16.09■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 TMEM50BP56557 158 aa16.09■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 HSF1Q00613 529 aa16.09■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 SQSTM1Q13501 440 aa16.09■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 ARFRP1Q13795 201 aa16.09■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 GPR157Q5UAW9 335 aa16.09■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa16.09■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 BHLHE23Q8NDY6 225 aa16.09■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 OR13H1Q8NG92 308 aa16.09■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 OR8U1Q8NH10 309 aa16.09■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 C11orf40Q8WZ69 217 aa16.09■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 GAL3ST4Q96RP7 486 aa16.09■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 GINS3Q9BRX5 216 aa16.09■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 WWTR1Q9GZV5 400 aa16.09■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 DECR2Q9NUI1 292 aa16.09■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 LILRA5A6NI73 299 aa16.08■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 E5RGE8 158 aa16.08■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 IFNA17P01571 189 aa16.08■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 NAT2P11245 290 aa16.08■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 PRF1P14222 555 aa16.08■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 ACKR3P25106 362 aa16.08■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 LMO1P25800 156 aa16.08■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 LAP3P28838 519 aa16.08■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 BLKP51451 505 aa16.08■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 GUK1Q16774 197 aa16.08■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 TMEM240Q5SV17 173 aa16.08■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 THEM4Q5T1C6 240 aa16.08■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 DOK3Q7L591 496 aa16.08■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 SGPP2Q8IWX5 399 aa16.08■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 PRR22Q8IZ63 422 aa16.08■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 ZNF441Q8N8Z8 693 aa16.08■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 SECTM1Q8WVN6 248 aa16.08■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 TGM7Q96PF1 710 aa16.08■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 SCRT1Q9BWW7 348 aa16.08■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 CHRDQ9H2X0 955 aa16.08■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 COPS7AQ9UBW8 275 aa16.08■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 MIOXQ9UGB7 285 aa16.08■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 AMDHD2Q9Y303 409 aa16.08■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 NSG2Q9Y328 171 aa16.08■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 DMRT1Q9Y5R6 373 aa16.08■□□□□ 0.17
KRCC1-201ENST00000347055 SPTBP11277 2137 aa16.08■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 ANKUB1A6NFN9 424 aa16.08■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 RAD51DO75771 328 aa16.08■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 CTSEP14091 401 aa16.08■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 SNU13P55769 128 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 FMODQ06828 376 aa16.08■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 C9orf40Q8IXQ3 194 aa16.08■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa16.08■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 TMEM104Q8NE00 496 aa16.08■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 CCDC54Q8NEL0 328 aa16.08■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa16.08■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 OR8G5Q8NG78 346 aa16.08■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 FGF14Q92915 247 aa16.08■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 C5orf34Q96MH7 638 aa16.08■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 TM2D1Q9BX74 207 aa16.08■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 EHFQ9NZC4 300 aa16.08■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 TRAV20A0A0B4J274 112 aa16.07■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa16.07■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 HTR3BO95264 441 aa16.07■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 OR8U8P0C7N1 319 aa16.07■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 HLA-DOBP13765 273 aa16.07■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 FASLGP48023 281 aa16.07■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 CCR5P51681 352 aa16.07■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 TMEM33P57088 247 aa16.07■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 IGSF11Q5DX21 431 aa16.07■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa16.07■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 ALKBH4Q9NXW9 302 aa16.07■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 GSKIPQ9P0R6 139 aa16.07■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 SFTPBP07988 381 aa16.06■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 HOXB5P09067 269 aa16.06■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 BCKDHBP21953 392 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.2 ms