RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491530.5

CHTF18-211, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 819 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-211ENST00000491530 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
CHTF18-211ENST00000491530 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
CHTF18-211ENST00000491530 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 GRM1Q13255 1194 aa19.2■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 TMC4Q7Z404 712 aa19.2■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 SP8Q8IXZ3 490 aa19.2■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 COPRSQ9NQ92 184 aa19.2■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 WBP1LQ9NX94 342 aa19.2■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 LBX1P52954 281 aa19.19■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 LRRC24Q50LG9 513 aa19.19■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 TAF7LQ5H9L4 462 aa19.19■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 SUPT20HQ8NEM7 779 aa19.19■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 PRDM10Q9NQV6 1147 aa19.19■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 MINPP1Q9UNW1 487 aa19.19■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa19.19■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 TRAF5O00463 557 aa19.18■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 CXCL9Q07325 125 aa19.18■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 AAMPQ13685 434 aa19.18■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa19.18■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 ATG9AQ7Z3C6 839 aa19.18■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 MPNDQ8N594 471 aa19.18■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 MPHOSPH8Q99549 860 aa19.18■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 ZNRF3Q9ULT6 936 aa19.18■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 SCN9AQ15858 1988 aa19.17■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 SIL1Q9H173 461 aa19.17■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 VPS33BQ9H267 617 aa19.17■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 GPRC5DQ9NZD1 345 aa19.17■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 EYA2O00167 538 aa19.16■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 GPSM2P81274 684 aa19.16■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 RAD17O75943 681 aa19.15■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 CHRNDQ07001 517 aa19.15■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 CIAPIN1Q6FI81 312 aa19.15■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 CYP4F22Q6NT55 531 aa19.15■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 CNNM1Q9NRU3 951 aa19.15■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 FBXO3Q9UK99 471 aa19.15■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
CHTF18-211ENST00000491530 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 CIAO1O76071 339 aa19.14■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 KIAA2012Q0VF49 1180 aa19.14■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 CST9Q5W186 159 aa19.14■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 CAPNS2Q96L46 248 aa19.14■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 PODXL2Q9NZ53 605 aa19.14■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 TRPM7Q96QT4 1865 aa19.14■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 HMMRO75330 724 aa19.13■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 VGLL2Q8N8G2 317 aa19.13■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 XDHP47989 1333 aa19.12■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 MROH5Q6ZUA9 1318 aa19.12■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 SNAP23O00161 211 aa19.12■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 TAF5LO75529 589 aa19.12■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 SURF6O75683 361 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 ECE1P42892 770 aa19.12■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 POLLQ9UGP5 575 aa19.12■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa19.12■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 SASH1O94885 1247 aa19.11■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 IL15P40933 162 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 TNIP1Q15025 636 aa19.11■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 BEGAINQ9BUH8 593 aa19.11■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 ANKRD2Q9GZV1 360 aa19.11■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 ZNF408Q9H9D4 720 aa19.11■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 TLL2Q9Y6L7 1015 aa19.11■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 CELF2O95319 508 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 METTL24Q5JXM2 366 aa19.1■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 TBC1D16Q8TBP0 767 aa19.1■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 TRPM4Q8TD43 1214 aa19.1■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa19.1■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 ARAP2Q8WZ64 1704 aa19.1■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 THSD7BQ9C0I4 1608 aa19.1■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 IRS2Q9Y4H2 1338 aa19.09■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 YDJCA8MPS7 323 aa19.09■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 AOC2O75106 756 aa19.09■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 NEFLP07196 543 aa19.09■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP19.09■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 DCTPP1Q9H773 170 aa19.09■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
CHTF18-211ENST00000491530 SHTN1A0MZ66 631 aa19.08■□□□□ 0.64
CHTF18-211ENST00000491530 RIMBP2O15034 1052 aa19.08■□□□□ 0.64
CHTF18-211ENST00000491530 UFL1O94874 794 aa19.08■□□□□ 0.64
CHTF18-211ENST00000491530 PDE8BO95263 885 aa19.08■□□□□ 0.64
CHTF18-211ENST00000491530 IGHDP01880 384 aa19.08■□□□□ 0.64
CHTF18-211ENST00000491530 ATP2B4P23634 1241 aa19.08■□□□□ 0.64
CHTF18-211ENST00000491530 TFCP2Q12800 502 aa19.08■□□□□ 0.64
CHTF18-211ENST00000491530 DBNDD1Q9H9R9 158 aa19.08■□□□□ 0.64
CHTF18-211ENST00000491530 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
CHTF18-211ENST00000491530 GGA1Q9UJY5 639 aa19.08■□□□□ 0.64
CHTF18-211ENST00000491530 LEMD3Q9Y2U8 911 aa19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.2 ms