RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617062.4

CU633904.1-201, humanhuman

TSL 5

Gene CU633904.1, Length 560 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU633904.1-201ENST00000617062 PRTN3P24158 256 aa7.33□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 RPS27P42677 84 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 ACTG1P63261 375 aa7.33□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 CDK5Q00535 292 aa7.33□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 OR8B8Q15620 311 aa7.33□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 DNAL1Q4LDG9 190 aa7.33□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 SLC35D3Q5M8T2 416 aa7.33□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 TEX36Q5VZQ5 186 aa7.33□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 LYPD4Q6UWN0 246 aa7.33□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 OR56B2PQ8NGI1 322 aa7.33□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 OR51L1Q8NGJ5 315 aa7.33□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 OR6K6Q8NGW6 343 aa7.33□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 NRBF2Q96F24 287 aa7.33□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 INTS14Q96SY0 518 aa7.33□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 TLNRD1Q9H1K6 362 aa7.33□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 RASSF4Q9H2L5 321 aa7.33□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 YY1AP1Q9H869 796 aa7.33□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa7.33□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 ABCB9Q9NP78 766 aa7.33□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 C14orf119Q9NWQ9 140 aa7.33□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 FAM53CQ9NYF3 392 aa7.33□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 KAAG1Q9UBP8 84 aa7.33□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 CLN8Q9UBY8 286 aa7.33□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 ZNF69Q9UC07 566 aa7.33□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 U3KQV3 271 aa7.33□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 VWFP04275 2813 aa7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 GGT3PA6NGU5 568 aa7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 ENSAO43768 121 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 GYPBP06028 91 aa7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 HKR1P10072 659 aa7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 CLUP10909 449 aa7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 OSMP13725 252 aa7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 ANXA8P13928 327 aa7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 ANOS1P23352 680 aa7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 MTNR1AP48039 350 aa7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 CX3CR1P49238 355 aa7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 FAM3AP98173 230 aa7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 TAF13Q15543 124 aa7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 MPPED2Q15777 294 aa7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 CD276Q5ZPR3 534 aa7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 SLC16A9Q7RTY1 509 aa7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 DPY19L4Q7Z388 723 aa7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 PARP8Q8N3A8 854 aa7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 FTMTQ8N4E7 242 aa7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 OR2AE1Q8NHA4 323 aa7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 OTOSQ8NHW6 89 aa7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 CANT1Q8WVQ1 401 aa7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 RHOVQ96L33 236 aa7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 ABHD6Q9BV23 337 aa7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 NIPAL2Q9H841 368 aa7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 SLC25A19Q9HC21 320 aa7.32□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 C5orf63A6NC05 138 aa7.31□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 OOEPA6NGQ2 149 aa7.31□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa7.31□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 ACOD1A6NK06 481 aa7.31□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa7.31□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 H3BN98 237 aa7.31□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 ECDO95905 644 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 LYNP07948 512 aa7.31□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 MMP9P14780 707 aa7.31□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 SLC2A5P22732 501 aa7.31□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 HSD11B1P28845 292 aa7.31□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 RBMXP38159 391 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 PRKXP51817 358 aa7.31□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 FOXL1Q12952 345 aa7.31□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 KLHL12Q53G59 568 aa7.31□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 FAM76BQ5HYJ3 339 aa7.31□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 FAM201AQ5SY85 155 aa7.31□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa7.31□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 DEGS2Q6QHC5 323 aa7.31□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa7.31□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 GALNT4Q8N4A0 578 aa7.31□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 GCSAMQ8N6F7 178 aa7.31□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa7.31□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 OR6N2Q8NGY6 317 aa7.31□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 SGMS2Q8NHU3 365 aa7.31□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 SGK3Q96BR1 496 aa7.31□□□□□ -1.24
CU633904.1-201ENST00000617062 REEP6Q96HR9 211 aa7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms