RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	GNB2	P62879	340 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	TIGD6	Q17RP2	521 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	ALOX5AP	P20292	161 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	PITPNB	P48739	271 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	GSK3A	P49840	483 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	WDR86	Q86TI4	376 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	THEM6	Q8WUY1	208 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	OR8B2	Q96RD0	313 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	MRI1	Q9BV20	369 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	TEX12	Q9BXU0	123 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	OR10A2	Q9H208	303 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	LHB	P01229	141 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	RASSF2	P50749	326 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	OR8B8	Q15620	311 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP6AP1	Q15904	470 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	SNAPC1	Q16533	368 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	RGCC	Q9H4X1	137 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	ESM1	Q9NQ30	184 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	NUP50	Q9UKX7	468 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PPP4C-205	ENST00000563200	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC182	A6NF36	153 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	LGALS8	O00214	317 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	PHYH	O14832	338 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP5H	O75947	161 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	GRP	P07492	148 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	FPR2	P25090	351 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	MZT1	Q08AG7	82 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	APOF	Q13790	326 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	18.14	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	JMJD8	Q96S16	334 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	TEAD3	Q99594	435 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	BRD7	Q9NPI1	651 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	CLN8	Q9UBY8	286 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	HCCS	P53701	268 aa		18.13	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	18.13	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	18.13	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	ESRRG	P62508	458 aa		18.13	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	EFNB1	P98172	346 aa		18.13	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		18.13	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	18.13	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		18.13	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	PGAM5	Q96HS1	289 aa		18.13	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		18.13	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	NIPAL2	Q9H841	368 aa		18.13	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		18.13	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF69	Q9UC07	566 aa		18.13	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	LRP12	Q9Y561	859 aa		18.13	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	OOEP	A6NGQ2	149 aa		18.12	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	C3orf80	F5H4A9	247 aa		18.12	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	PRKY	O43930	277 aa		18.12	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	18.12	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	ACKR3	P25106	362 aa		18.12	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	EPHA2	P29317	976 aa		18.12	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNJ8	Q15842	424 aa		18.12	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		18.12	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		18.12	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	OR8S1	Q8NH09	359 aa		18.12	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	UPRT	Q96BW1	309 aa		18.12	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	ITPKC	Q96DU7	683 aa		18.12	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	LYZL4	Q96KX0	146 aa		18.12	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		18.12	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	PRR32	B1ATL7	298 aa		18.11	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	C22orf46	C9J442	243 aa		18.11	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200		G3V2T6	193 aa		18.11	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM77	I1YAP6	450 aa		18.11	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	EGR1	P18146	543 aa		18.11	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		18.11	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		18.11	■□□□□ 0.49
PPP4C-205	ENST00000563200	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	18.11	■□□□□ 0.49

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