RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 EID2Q8N6I1 236 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 OR51L1Q8NGJ5 315 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 KLHL13Q9P2N7 655 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 ZNF860A6NHJ4 632 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 B3GALT2O43825 422 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 ACKR3P25106 362 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 PSMB6P28072 239 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 LIMS1P48059 325 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 SQSTM1Q13501 440 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 ARFRP1Q13795 201 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 ABCA11PQ4W5N1 156 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 XAGE5Q8WWM1 108 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 IL21Q9HBE4 155 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 POPDC3Q9HBV1 291 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 LRRC37AA6NMS7 1700 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 A0A1W2PRS3 328 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 TRBC2A0A5B9 178 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 JTBO76095 146 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 PMCHP20382 165 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 DPP4P27487 766 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 ADRA1AP35348 466 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 OR4F3Q6IEY1 312 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 HMGN2P46Q86SG4 172 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 GDF15Q99988 308 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 WIPI2Q9Y4P8 454 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 A0A1B0GVT2 93 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 OR4C45A6NMZ5 311 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 COLCA2A8K830 154 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 ZNF727A8MUV8 499 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 MDKP21741 143 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 TAS2R31P59538 309 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 DECR1Q16698 335 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 SPATA45Q537H7 98 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 OR5AU1Q8NGC0 362 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 OR9Q2Q8NGE9 314 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 ADAMTS15Q8TE58 950 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 LRRC3BQ96PB8 259 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 REG4Q9BYZ8 158 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 AMDHD2Q9Y303 409 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 SLC22A31A6NKX4 558 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 B4DEV8 164 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 FAM227AF5H4B4 570 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 GLCEO94923 617 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 TAS2R50P59544 299 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 Q6ZS52 159 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 GALNT16Q8N428 558 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 PLAC1Q9HBJ0 212 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 PCDH7O60245 1069 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 RCBTB2O95199 551 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 IL5P05113 134 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 GSTM3P21266 225 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 ZNF266Q14584 549 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 ASCL4Q6XD76 172 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 FA2HQ7L5A8 372 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 BLNKQ8WV28 456 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 OR1A1Q9P1Q5 309 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 CLN8Q9UBY8 286 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 FOXJ3Q9UPW0 622 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 AUP1Q9Y679 476 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-202ENST00000382998 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.43
CTIF-202ENST00000382998 OR6A2O95222 327 aa12.4□□□□□ -0.43
CTIF-202ENST00000382998 AGAP20933 346 aa12.4□□□□□ -0.43
CTIF-202ENST00000382998 LILRA6Q6PI73 481 aa12.4□□□□□ -0.43
CTIF-202ENST00000382998 CMTM4Q8IZR5 234 aa12.4□□□□□ -0.43
CTIF-202ENST00000382998 LINC00471Q8N535 108 aa12.4□□□□□ -0.43
CTIF-202ENST00000382998 MOB3AQ96BX8 217 aa12.4□□□□□ -0.43
CTIF-202ENST00000382998 CD180Q99467 661 aa12.4□□□□□ -0.43
CTIF-202ENST00000382998 IL26Q9NPH9 171 aa12.4□□□□□ -0.43
CTIF-202ENST00000382998 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.43
CTIF-202ENST00000382998 DOCK5Q9H7D0 1870 aa12.39□□□□□ -0.43
CTIF-202ENST00000382998 STK17BO94768 372 aa12.39□□□□□ -0.43
CTIF-202ENST00000382998 PRPH2P23942 346 aa12.39□□□□□ -0.43
CTIF-202ENST00000382998 ZNF154Q13106 437 aa12.39□□□□□ -0.43
CTIF-202ENST00000382998 ABRAXAS2Q15018 415 aa12.39□□□□□ -0.43
CTIF-202ENST00000382998 TMEM183AQ8IXX5 376 aa12.39□□□□□ -0.43
CTIF-202ENST00000382998 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa12.39□□□□□ -0.43
CTIF-202ENST00000382998 ZNF676Q8N7Q3 588 aa12.39□□□□□ -0.43
CTIF-202ENST00000382998 MDGA1Q8NFP4 955 aa12.39□□□□□ -0.43
CTIF-202ENST00000382998 OR1N2Q8NGR9 330 aa12.39□□□□□ -0.43
CTIF-202ENST00000382998 ARRDC3Q96B67 414 aa12.39□□□□□ -0.43
CTIF-202ENST00000382998 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa12.39□□□□□ -0.43
CTIF-202ENST00000382998 TAAR9Q96RI9 348 aa12.39□□□□□ -0.43
CTIF-202ENST00000382998 PRRG4Q9BZD6 226 aa12.39□□□□□ -0.43
CTIF-202ENST00000382998 ZNF160Q9HCG1 818 aa12.39□□□□□ -0.43
CTIF-202ENST00000382998 CYSLTR2Q9NS75 346 aa12.39□□□□□ -0.43
CTIF-202ENST00000382998 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
CTIF-202ENST00000382998 TAAR5O14804 337 aa12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 115.7 ms