RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428584.5

TTC28-AS1-207, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,859 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C17orf107Q6ZR85 190 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RDH5Q92781 318 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DEFB127Q9H1M4 99 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF586Q9NXT0 402 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR52B4Q8NGK2 314 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UFSP2Q9NUQ7 469 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RPL11P62913 178 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ERHP84090 104 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UQCC3Q6UW78 93 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SLC24A4Q8NFF2 622 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM122AQ96E09 287 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C12orf10Q9HB07 376 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SERPINE3A8MV23 424 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 G3V3Q6 166 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TSPAN12O95859 305 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IL2RAP01589 272 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF561Q8N587 486 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM104Q8NE00 496 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MYEOVQ96EZ4 313 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRIB1Q96RU8 372 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 S1PR3Q99500 378 aa13.48□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PI3P19957 117 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PPP2CBP62714 309 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PPP2CAP67775 309 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NCR3LG1Q68D85 454 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TEX261Q6UWH6 196 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RXFP4Q8TDU9 374 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SMIM7Q9BQ49 75 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NMES1Q9C002 83 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 U3KQ87 197 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRR35P0CG20 571 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LIMS3P0CW19 117 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LIMS4P0CW20 117 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RRASP10301 218 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RAB5AP20339 215 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GPR3P46089 330 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FUT6P51993 359 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LINC00303Q3SY05 128 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRSS36Q5K4E3 855 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KIRREL2Q6UWL6 708 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CHRDL1Q9BU40 450 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A4GNTQ9UNA3 340 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM221AA4D161 298 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 F2RP25116 425 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PCED1AQ9H1Q7 454 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SLC17A5Q9NRA2 495 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 XKRY2A2RUG3 117 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RAB35Q15286 201 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CXorf58Q96LI9 332 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CABLES2Q9BTV7 478 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MENTQ9BUN1 341 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF385DQ9H6B1 395 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CRLF2Q9HC73 371 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LOXL2Q9Y4K0 774 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AQP8O94778 261 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZP3P21754 424 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HAAOP46952 286 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C9orf152Q5JTZ5 239 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MRGPRX1Q96LB2 322 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RHNO1Q9BSD3 238 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NDFIP1Q9BT67 221 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CLCF1Q9UBD9 225 aa13.47□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RFPL4AA6NLU0 287 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SLC17A2O00624 439 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CYTIPO60759 359 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR2A1Q8NGT9 310 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ST3GAL6Q9Y274 331 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CYC1P08574 325 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GLI4P10075 376 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C11orf87Q6NUJ2 197 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DRAM2Q6UX65 266 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KIAA1958Q8N8K9 716 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TTC9Q92623 222 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C8orf44Q96CB5 159 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ATP23Q9Y6H3 246 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A096LPE4 126 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A1W2PPZ6 126 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LILRA5A6NI73 299 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CEACAM5P06731 702 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FGF7P21781 194 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CLN3Q13286 438 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZBTB37Q5TC79 503 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR4S1Q8NGB4 309 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCL4L1Q8NHW4 92 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM18Q96B42 140 aa13.46□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms