RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 SLC3A1Q07837 685 aa17.59■□□□□ 0.41
CS-222ENST00000550996 KLHL12Q53G59 568 aa17.59■□□□□ 0.41
CS-222ENST00000550996 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
CS-222ENST00000550996 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
CS-222ENST00000550996 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa17.59■□□□□ 0.41
CS-222ENST00000550996 NPTNQ9Y639 398 aa17.59■□□□□ 0.41
CS-222ENST00000550996 ISPDA4D126 451 aa17.58■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 CCDC182A6NF36 153 aa17.58■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 CD300LBA8K4G0 201 aa17.58■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 M0R129 80 aa17.58■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 SRD5A1P18405 259 aa17.58■□□□□ 0.4
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CS-222ENST00000550996 PMELP40967 661 aa17.58■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 ZMYND11Q15326 602 aa17.58■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 TAF13Q15543 124 aa17.58■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 PRSS45Q7RTY3 260 aa17.58■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
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CS-222ENST00000550996 OR51F2Q8NH61 342 aa17.58■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 GAL3ST1Q99999 423 aa17.58■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa17.58■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 TMEM100Q9NV29 134 aa17.58■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 TVP23BQ9NYZ1 205 aa17.58■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa17.58■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 G3V2T6 193 aa17.57■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 TMEM178BH3BS89 294 aa17.57■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 PRODHO43272 600 aa17.57■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 PLPP2O43688 288 aa17.57■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 PRKYO43930 277 aa17.57■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 CX3CR1P49238 355 aa17.57■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 MAB21L1Q13394 359 aa17.57■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 SNAPC1Q16533 368 aa17.57■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 KDM4DQ6B0I6 523 aa17.57■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 OTOSQ8NHW6 89 aa17.57■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 RAB39BQ96DA2 213 aa17.57■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 G6PC2Q9NQR9 355 aa17.57■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 UBAP1Q9NZ09 502 aa17.57■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 ZNF319Q9P2F9 582 aa17.57■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 DYSFO75923 2080 aa17.57■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 SBK2P0C263 348 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 GRB2P62993 217 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
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CS-222ENST00000550996 SHFQ7M4L6 423 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 MOGAT3Q86VF5 341 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 OR56B2PQ8NGI1 322 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 SPSB4Q96A44 273 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 PLEKHA8Q96JA3 519 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 KRT84Q9NSB2 600 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 WNK2Q9Y3S1 2297 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 CIB2O75838 187 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 ZNF205O95201 554 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
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CS-222ENST00000550996 CA6P23280 308 aa17.55■□□□□ 0.4
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CS-222ENST00000550996 SRP9P49458 86 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 HCCSP53701 268 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 BTG1P62324 171 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 ESRRGP62508 458 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 SLC35D3Q5M8T2 416 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 TOR3AQ9H497 397 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 TRAV20A0A0B4J274 112 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 ZAR1LA6NP61 321 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 PRR32B1ATL7 298 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 AVPP01185 164 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 FCGR1AP12314 374 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 CD200P41217 278 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 GATA4P43694 442 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 RAD23AP54725 363 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 RPS7P62081 194 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 EFNB1P98172 346 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 FAM201AQ5SY85 155 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 SLX4IPQ5VYV7 408 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 FAM57BQ71RH2 274 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 ZNF454Q8N9F8 522 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 PYDC1Q8WXC3 89 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 SGK3Q96BR1 496 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 CIB1Q99828 191 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 OAZ3Q9UMX2 235 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-222ENST00000550996 GGT3PA6NGU5 568 aa17.53■□□□□ 0.4
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