RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530120.5

CSRP1-213, Transcript of cysteine and glycine rich protein 1, human

TSL 4

Gene CSRP1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSRP1-213	ENST00000530120	ST7L	Q8TDW4	575 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CSRP1-213	ENST00000530120	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CSRP1-213	ENST00000530120	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CSRP1-213	ENST00000530120	TPD52L3	Q96J77	140 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CSRP1-213	ENST00000530120	C4orf45	Q96LM5	186 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CSRP1-213	ENST00000530120	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CSRP1-213	ENST00000530120	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CSRP1-213	ENST00000530120	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CSRP1-213	ENST00000530120	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CSRP1-213	ENST00000530120	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CSRP1-213	ENST00000530120	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CSRP1-213	ENST00000530120	ESM1	Q9NQ30	184 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CSRP1-213	ENST00000530120	KRT84	Q9NSB2	600 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CSRP1-213	ENST00000530120	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CSRP1-213	ENST00000530120	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CSRP1-213	ENST00000530120	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CSRP1-213	ENST00000530120	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CSRP1-213	ENST00000530120	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CSRP1-213	ENST00000530120	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	IFNL4	K9M1U5	179 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	XKRY	O14609	159 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	SURF4	O15260	269 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	FOXH1	O75593	365 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	ABHD16A	O95870	558 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	ADRA2C	P18825	462 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	MAK	P20794	623 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	LAP3	P28838	519 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	MPV17	P39210	176 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	CTXN1	P60606	82 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	PRKCD	Q05655	676 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	LAPTM4A	Q15012	233 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	IFI44L	Q53G44	452 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	NRM	Q8IXM6	262 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	CCL17	Q92583	94 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	POLE4	Q9NR33	117 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120		A0A1B0GVG6	124 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120		A0A1W2PPL8	197 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	ISPD	A4D126	451 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120		E9PQ18	207 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	SPRY3	O43610	288 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	PIP5K1C	O60331	668 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	HTR1A	P08908	422 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	PRKACG	P22612	351 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	DAP	P51397	102 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	AQP6	Q13520	282 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	ADCK1	Q86TW2	530 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	FCGR1B	Q92637	280 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	C7orf34	Q96L11	122 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	SAMD8	Q96LT4	415 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	DUSP21	Q9H596	190 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	NPTN	Q9Y639	398 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120		U3KQV3	271 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	POM121C	A8CG34	1229 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120		A8MXK9	166 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	SGCE	O43556	437 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	DOK2	O60496	412 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	FAM20B	O75063	409 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	AVP	P01185	164 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	FSHB	P01225	129 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	CD14	P08571	375 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	ANXA8	P13928	327 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	KITLG	P21583	273 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CSRP1-213	ENST00000530120	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79

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