RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		16.43	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		16.43	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	COQ8A	Q8NI60	647 aa		16.43	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	RELT	Q969Z4	430 aa		16.43	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	FAM46B	Q96A09	425 aa		16.43	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	GAL3ST1	Q99999	423 aa		16.43	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	CA14	Q9ULX7	337 aa		16.43	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		16.43	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PNV4	684 aa		16.43	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	LIPT2	A6NK58	231 aa		16.43	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	16.43	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	BPNT1	O95861	308 aa		16.43	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	CD8A	P01732	235 aa		16.43	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	HEXB	P07686	556 aa		16.43	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		16.43	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		16.43	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		16.43	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	16.43	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		16.43	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	16.43	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	FAM206A	Q9NX38	181 aa		16.43	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	16.43	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	CPED1	A4D0V7	1026 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM235	A6NFC5	223 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	BEST3	Q8N1M1	668 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	FGGY	Q96C11	551 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	PPA2	Q9H2U2	334 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	MED29	Q9NX70	200 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	KLK13	Q9UKR3	277 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	VDAC3	Q9Y277	283 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0D9SG52	128 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1B0GW55	424 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	SYT7	O43581	403 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	GSK3A	P49840	483 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	FOXF1	Q12946	379 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	DHRS2	Q13268	280 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	THEM4	Q5T1C6	240 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	OR10K2	Q6IF99	312 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	ARSK	Q6UWY0	536 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A45	Q8N413	288 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	DUX4	Q9UBX2	424 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		16.42	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		16.41	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	16.41	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	C2orf72	A6NCS6	295 aa		16.41	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	ALOX12B	O75342	701 aa		16.41	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	SCO1	O75880	301 aa		16.41	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	MPG	P29372	298 aa		16.41	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	GNAL	P38405	381 aa		16.41	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	BID	P55957	195 aa		16.41	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	16.41	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	SQSTM1	Q13501	440 aa		16.41	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		16.41	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		16.41	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		16.41	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	CORO6	Q6QEF8	472 aa		16.41	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF546	Q86UE3	836 aa		16.41	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	ACBD4	Q8NC06	268 aa		16.41	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		16.41	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		16.41	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		16.41	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	RNF138	Q8WVD3	245 aa		16.41	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		16.41	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	NPAS1	Q99742	590 aa		16.41	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		16.41	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	16.41	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		16.41	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		16.41	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		16.41	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		16.41	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	16.41	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		16.41	■□□□□ 0.22
RRN3-205	ENST00000563559	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		16.41	■□□□□ 0.22

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