RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531041.1

SF3B2-211, Transcript of splicing factor 3b subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SF3B2, Length 1,440 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SF3B2-211ENST00000531041 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SF3B2-211ENST00000531041 ZNF799Q96GE5 643 aa14.62□□□□□ -0.07
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SF3B2-211ENST00000531041 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa14.62□□□□□ -0.07
SF3B2-211ENST00000531041 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SF3B2-211ENST00000531041 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SF3B2-211ENST00000531041 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa14.62□□□□□ -0.07
SF3B2-211ENST00000531041 LRP12Q9Y561 859 aa14.62□□□□□ -0.07
SF3B2-211ENST00000531041 DSCAMO60469 2012 aa14.62□□□□□ -0.07
SF3B2-211ENST00000531041 ABHD16AO95870 558 aa14.61□□□□□ -0.07
SF3B2-211ENST00000531041 APOC1P02654 83 aa14.61□□□□□ -0.07
SF3B2-211ENST00000531041 HSD11B1P28845 292 aa14.61□□□□□ -0.07
SF3B2-211ENST00000531041 RAD52P43351 418 aa14.61□□□□□ -0.07
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