RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 SPEF1Q9Y4P9 236 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 WIF1Q9Y5W5 379 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 KNTC1P50748 2209 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 SDK2Q58EX2 2172 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 A0A0B4J203 849 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 A0A1W2PPK0 400 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 ACOD1A6NK06 481 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 CDK2AP1O14519 115 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 PIN1P1O15428 100 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 XRCC3O43542 346 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 RP2O75695 350 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 B3GALNT1O75752 331 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 RBBP9O75884 186 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 GLSO94925 669 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 ZFPL1O95159 310 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 ZP3P21754 424 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 ITPKBP27987 946 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 MAP2K6P52564 334 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 CAPZA1P52907 286 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 SOX8P57073 446 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 ACTBP60709 375 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 ACTG1P63261 375 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 AANATQ16613 207 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 ALG10Q5BKT4 473 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 LINC01590Q5TEZ4 76 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 STAC2Q6ZMT1 411 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 C3P1Q6ZMU1 363 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 FCRLAQ7L513 359 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 CDC20BQ86Y33 519 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 GLB1L2Q8IW92 636 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 CDH26Q8IXH8 852 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF563Q8TA94 476 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 POC1BQ8TC44 478 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 GPR148Q8TDV2 347 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 THEM6Q8WUY1 208 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 CCDC107Q8WV48 283 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM234Q8WY98 164 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 TAAR8Q969N4 342 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 ELMOD3Q96FG2 381 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 MAP6Q96JE9 813 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 MOGAT1Q96PD6 335 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 RBP7Q96R05 134 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 NPAS1Q99742 590 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 SLC25A18Q9H1K4 315 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 OR10A4Q9H209 315 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 PPA2Q9H2U2 334 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 WDR76Q9H967 626 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 OR5V1Q9UGF6 321 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 STEAP1Q9UHE8 339 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 GLS2Q9UI32 602 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 LAMP5Q9UJQ1 280 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 COPS3Q9UNS2 423 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 TMED7Q9Y3B3 224 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR1A-208ENST00000486964 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 PLSCR5A0PG75 271 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM72A0PK05 275 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 OR6C68A6NDL8 312 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 A8MVM7 634 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 KRBOX1C9JBD0 128 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 FTCDNL1E5RQL4 147 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 H7C417 338 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 SULT1C2O00338 296 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 GNB5O14775 395 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF208O43345 1280 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 GMDSO60547 372 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 HPXP02790 462 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 HIST1H2ABP04908 130 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 PPP3CBP16298 524 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 CDK2P24941 298 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 CXCR1P25024 350 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 PSMB10P40306 273 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 SELENOPP49908 381 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 CCR4P51679 360 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 ERVK-25P63136 954 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 POU4F3Q15319 338 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 PLPPR5Q32ZL2 321 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 ACER2Q5QJU3 275 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 DCAF10Q5QP82 559 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 C1QL3Q5VWW1 255 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 OR5M10Q6IEU7 315 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 FDX2Q6P4F2 183 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 C5orf46Q6UWT4 87 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 ARSKQ6UWY0 536 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa8.58□□□□□ -1.04
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