RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 RNH1P13489 461 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PDE4D-217ENST00000509355 CPN1P15169 458 aa3.7□□□□□ -1.82
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PDE4D-217ENST00000509355 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PDE4D-217ENST00000509355 PRDX2P32119 198 aa3.7□□□□□ -1.82
PDE4D-217ENST00000509355 FOXN2P32314 431 aa3.7□□□□□ -1.82
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PDE4D-217ENST00000509355 CDK9P50750 372 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
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PDE4D-217ENST00000509355 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP3.7□□□□□ -1.82
PDE4D-217ENST00000509355 PDK2Q15119 407 aa3.7□□□□□ -1.82
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PDE4D-217ENST00000509355 EIPR1Q53HC9 387 aa3.7□□□□□ -1.82
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PDE4D-217ENST00000509355 APOL2Q9BQE5 337 aa3.7□□□□□ -1.82
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PDE4D-217ENST00000509355 GON7Q9BXV9 100 aa3.7□□□□□ -1.82
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PDE4D-217ENST00000509355 OR8D2Q9GZM6 311 aa3.7□□□□□ -1.82
PDE4D-217ENST00000509355 ACTR6Q9GZN1 396 aa3.7□□□□□ -1.82
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PDE4D-217ENST00000509355 BCAP29Q9UHQ4 241 aa3.7□□□□□ -1.82
PDE4D-217ENST00000509355 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa3.7□□□□□ -1.82
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PDE4D-217ENST00000509355 KLHL21Q9UJP4 597 aa3.7□□□□□ -1.82
PDE4D-217ENST00000509355 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PDE4D-217ENST00000509355 SLC22A7Q9Y694 548 aa3.7□□□□□ -1.82
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PDE4D-217ENST00000509355 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa3.69□□□□□ -1.82
PDE4D-217ENST00000509355 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa3.69□□□□□ -1.82
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PDE4D-217ENST00000509355 ZCCHC18P0CG32 403 aa3.69□□□□□ -1.82
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PDE4D-217ENST00000509355 HSD17B2P37059 387 aa3.69□□□□□ -1.82
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PDE4D-217ENST00000509355 NCMAPQ5T1S8 102 aa3.69□□□□□ -1.82
PDE4D-217ENST00000509355 ANXA8L1Q5VT79 327 aa3.69□□□□□ -1.82
PDE4D-217ENST00000509355 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PDE4D-217ENST00000509355 OR4A47Q6IF82 309 aa3.69□□□□□ -1.82
PDE4D-217ENST00000509355 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PDE4D-217ENST00000509355 VN1R4Q7Z5H5 301 aa3.69□□□□□ -1.82
PDE4D-217ENST00000509355 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PDE4D-217ENST00000509355 MMD2Q8IY49 270 aa3.69□□□□□ -1.82
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