RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC75AQ8NAA5 344 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF540Q8NDQ6 660 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 OR1J2Q8NGS2 313 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 GIPC3Q8TF64 312 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF570Q96NI8 536 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 FOXN4Q96NZ1 517 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 DGCR6LQ9BY27 220 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 BPESC1Q9GZL8 116 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 KIF17Q9P2E2 1029 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 DUSP13Q9UII6 198 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 BAIAP2Q9UQB8 552 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 CDH10Q9Y6N8 788 aa6.58□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ARPC3O15145 178 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 LILRA1O75019 489 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 IFNGP01579 166 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 LCKP06239 509 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 CST2P09228 141 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 NAT2P11245 290 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF250P15622 560 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF23P17027 643 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 MSR1P21757 451 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 CCNOP22674 350 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 STOMP27105 288 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 LAP3P28838 519 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 NOS3P29474 1203 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 SDHAP31040 664 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 RAD52P43351 418 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 GSSP48637 474 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 GZMKP49863 264 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 SELENOVP59797 346 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 PCBD1P61457 104 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ERVS71-1P61550 626 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 SEC23BQ15437 767 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ATP6AP1Q15904 470 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ZSCAN26Q16670 478 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 RFX4Q33E94 735 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 MESTQ5EB52 335 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 FAM27BQ5VT28 67 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 CYB5R2Q6BCY4 276 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 PGBD2Q6P3X8 592 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF620Q6ZNG0 422 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ZER1Q7Z7L7 766 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF786Q8N393 782 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 AQP11Q8NBQ7 271 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ICA1LQ8NDH6 482 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 OR10G2Q8NGC3 310 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 OR4C15Q8NGM1 316 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 AKR7LQ8NHP1 331 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 SYNPRQ8TBG9 265 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 STMN2Q93045 179 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 RASD2Q96D21 266 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 Q96M85 177 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 SNX18Q96RF0 628 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 WACQ9BTA9 647 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 PRRG3Q9BZD7 231 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 BCL2L14Q9BZR8 327 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 MS4A5Q9H3V2 200 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 IL20RAQ9UHF4 553 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 SIGLEC7Q9Y286 467 aa6.57□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa6.56□□□□□ -1.36
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SGMS1-201ENST00000361543 PRSS37A4D1T9 235 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 C5orf49A4QMS7 147 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 C12orf71A8MTZ7 269 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 LYNX1G3V0Z9 82 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 PTP4A3O75365 173 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 NCR1O76036 304 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 TXNDC12O95881 172 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 CLPTM1O96005 669 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 HPXP02790 462 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 LYNX1P0DP58 116 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 CTLA4P16410 223 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 CRABP1P29762 137 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 GDI2P50395 445 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 CHN2P52757 468 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 UCP2P55851 309 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 PSG4Q00888 419 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 GLO1Q04760 184 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 RIN1Q13671 783 aa6.56□□□□□ -1.36
SGMS1-201ENST00000361543 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
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