RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 SIGLEC11Q96RL6 698 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF607Q96SK3 696 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM234AQ9H0X4 552 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 TPT1P8Q9HAU6 139 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 GCM1Q9NP62 436 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 MKS1Q9NXB0 559 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF229Q9UJW7 825 aa6.55□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0B4J2E0 115 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1B0GVI7 797 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1B0GX12 115 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 SMIM23A6NLE4 172 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 C12orf71A8MTZ7 269 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 J3QW42 95 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 FBP2O00757 339 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 MPIG6BO95866 241 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 ECDO95905 644 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 ECHS1P30084 290 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 WNT5AP41221 380 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 MELKQ14680 651 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 OR1Q1Q15612 314 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 C6orf10Q5SRN2 563 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 C10orf128Q5T292 105 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 HHATQ5VTY9 493 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF613Q6PF04 617 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 SYT9Q86SS6 491 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 CMTM4Q8IZR5 234 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4C13Q8NGP0 309 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 PTP4A1Q93096 173 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 LHX4Q969G2 390 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 ITCHQ96J02 903 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 MOGAT1Q96PD6 335 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 RBP7Q96R05 134 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM246Q9BRR3 403 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 DCAF16Q9NXF7 216 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 DOCK11Q5JSL3 2073 aa6.54□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 ELOVL7A1L3X0 281 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 CHP2O43745 196 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 PEX14O75381 377 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 CH25HO95992 272 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 CST2P09228 141 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 COX5BP10606 129 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 RAC2P15153 192 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 ACADSP16219 412 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 FAHP16930 419 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 CD33P20138 364 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 PAICSP22234 425 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 PPIBP23284 216 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 RGS6P49758 472 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL14P50914 215 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 ERVK-25P63136 954 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 PSG4Q00888 419 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 CD47Q08722 323 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 SCRN3Q0VDG4 424 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 NPTX1Q15818 432 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF74Q16587 644 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 HIST3H3Q16695 136 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM27BQ5VT28 67 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 OGFOD2Q6N063 350 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 AKR7LQ8NHP1 331 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 DPF1Q92782 380 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 HAVCR1Q96D42 359 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 CMBLQ96DG6 245 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 MPP4Q96JB8 637 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF347Q96SE7 839 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR61Q9BZJ8 451 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2H1Q9GZK4 316 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 RAP2CQ9Y3L5 183 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 PLXNB1O43157 2135 aa6.53□□□□□ -1.36
PGGT1B-201ENST00000296642 LOC100509620A0A075B734 347 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0U1RQK1 487 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 H0YL77 283 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 BPGMP07738 259 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC6A2P23975 617 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 HTR2AP28223 471 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 CDKN2CP42773 168 aa6.52□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 RAD23AP54725 363 aa6.52□□□□□ -1.37
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