RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497597.5

TRAPPC12-223, Transcript of trafficking protein particle complex 12, human

TSL 2

Gene TRAPPC12, Length 3,401 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAPPC12-223	ENST00000497597	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		9.64	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	9.64	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		9.64	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	VSIG4	Q9Y279	399 aa		9.64	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	TSTD3	H0UI37	97 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	CCL16	O15467	120 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	C1QL1	O75973	258 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	OR2C1	O95371	312 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	GAA	P10253	952 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	ZNF136	P52737	540 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	GAMT	Q14353	236 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	ELOC	Q15369	112 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	ULK3	Q6PHR2	472 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	PLXNB2	O15031	1838 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	ZNF727	A8MUV8	499 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	C4orf51	C9J302	202 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	GJA4	P35212	333 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	HRH1	P35367	487 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	GRK6	P43250	576 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	GSK3A	P49840	483 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	DIO1	P49895	249 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	ARFRP1	Q13795	201 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	MPPED2	Q15777	294 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	MARCH3	Q86UD3	253 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	SHISA5	Q8N114	240 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	DTD2	Q96FN9	168 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	DHDH	Q9UQ10	334 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	TCAP	O15273	167 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	ASCL1	P50553	236 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	PDGFRL	Q15198	375 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	IRF4	Q15306	451 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	SYS1	Q8N2H4	156 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		9.63	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	CD96	P40200	585 aa		9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	PYY3	Q5JQD4	70 aa		9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	LYG2	Q86SG7	212 aa		9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	OR2L13	Q8N349	312 aa		9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	WDR76	Q9H967	626 aa		9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	FBRS	Q9HAH7	460 aa		9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	ETV7	Q9Y603	341 aa		9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	ZNF726	A6NNF4	738 aa		9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	PHYH	O14832	338 aa		9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	TUBG1	P23258	451 aa		9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	ACKR3	P25106	362 aa		9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	HSD17B2	P37059	387 aa		9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	MIDN	Q504T8	468 aa		9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	SEH1L	Q96EE3	360 aa		9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	LMLN	Q96KR4	655 aa		9.62	□□□□□ -0.87
TRAPPC12-223	ENST00000497597	C9orf170	A2RU37	121 aa		9.62	□□□□□ -0.87

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