RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MT-ND2P03891 347 aa7.5□□□□□ -1.21
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PIPP12273 146 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ACTA1P68133 377 aa7.5□□□□□ -1.21
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PIGMQ9H3S5 423 aa7.49□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MARCH7Q9H992 704 aa7.49□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SIAEQ9HAT2 523 aa7.49□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 POLE4Q9NR33 117 aa7.49□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM38BQ9NVV0 291 aa7.49□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CLEC2DQ9UHP7 191 aa7.49□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SCOCQ9UIL1 159 aa7.49□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ERGIC3Q9Y282 383 aa7.49□□□□□ -1.21
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
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