RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 RBP7Q96R05 134 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 KCNK17Q96T54 332 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 TAS2R1Q9NYW7 299 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 NF1P21359 2839 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 SH3PXD2BA1X283 911 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 VSTM5A8MXK1 200 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 XKRYO14609 159 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 UBOX5O94941 541 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 CD8AP01732 235 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 CD14P08571 375 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 RRM2P31350 389 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 IFNGR2P38484 337 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 OMPP47874 163 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 LIMS1P48059 325 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 GIPRP48546 466 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 FHL1Q13642 323 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 SEC23BQ15437 767 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC36A2Q495M3 483 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 DNAL1Q4LDG9 190 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 THEM4Q5T1C6 240 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM53Q6P2H8 277 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 SKA3Q8IX90 412 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF519Q8TB69 540 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 ASB9Q96DX5 294 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 LRGUKQ96M69 825 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 Q96MF0 132 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 TSPAN32Q96QS1 320 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 THTPAQ9BU02 230 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 KCNN2Q9H2S1 579 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 MAGIXQ9H6Y5 334 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 SEC61A2Q9H9S3 476 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 CA10Q9NS85 328 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF224Q9NZL3 707 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 GRHPRQ9UBQ7 328 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 SIGLEC7Q9Y286 467 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 UNC119BA6NIH7 251 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 GYG2O15488 501 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 OR10H3O60404 316 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 KRT36O76013 467 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC2A10O95528 541 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 FOSL1P15407 271 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 NPR2P20594 1047 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 CALCRP30988 508 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 ERVK-25P63136 954 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 FMODQ06828 376 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 C11orf71Q6IPW1 123 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC16A14Q7RTX9 510 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 NUP37Q8NFH4 326 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF570Q96NI8 536 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 SH3GL3Q99963 347 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 FUZQ9BT04 418 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 BDH2Q9BUT1 245 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 CACNG6Q9BXT2 260 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 TRIM15Q9C019 465 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 RNF121Q9H920 327 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 NOX3Q9HBY0 568 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 SPEF1Q9Y4P9 236 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 TCRBV5S2A0A599 114 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 AHCYL1O43865 530 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 PTP4A3O75365 173 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 PTHP01270 115 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 MAGEA2P43356 314 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 MS4A2Q01362 244 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 GALK2Q01415 458 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 PLP2Q04941 152 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 GPR139Q6DWJ6 353 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 VHLLQ6RSH7 139 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 LINC00471Q8N535 108 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 NSMAFQ92636 917 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 FBXO17Q96EF6 278 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 MS4A3Q96HJ5 214 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 C1orf198Q9H425 327 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF442Q9H7R0 627 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 SIAEQ9HAT2 523 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 SERPINA5P05154 406 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 PATE4P0C8F1 98 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 FPR3P25089 353 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 SDHAP31040 664 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 SERPINF1P36955 418 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 RPS6KA3P51812 740 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms