RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411398.1

RNU6-1052P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1052, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1052P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RAPGEF5Q92565 580 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TNFRSF14Q92956 283 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TMEM45BQ96B21 275 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SEH1LQ96EE3 360 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DEFB118Q96PH6 123 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NACA2Q9H009 215 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TSPYL1Q9H0U9 437 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 INIPQ9NRY2 104 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MED9Q9NWA0 146 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 AIPL1Q9NZN9 384 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SPATA7Q9P0W8 599 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TBK1Q9UHD2 729 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NARFQ9UHQ1 456 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MYOFQ9NZM1 2061 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 A0A0B4J2A0 478 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OOEPA6NGQ2 149 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 H3BMH7 237 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 J3KRW8 73 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GMNNO75496 209 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ETHE1O95571 254 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GH1P01241 217 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IGHV3-11P01762 117 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IGHMP01871 453 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 THRAP10827 490 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZNF708P17019 499 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZNF18P17022 549 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CYP2B6P20813 491 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MPIP34949 423 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PITPNBP48739 271 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CCR8P51685 355 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CAPZA1P52907 286 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TFCP2Q12800 502 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PON2Q15165 354 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PON3Q15166 354 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLC15A2Q16348 729 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ACSBG2Q5FVE4 666 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TMEM205Q6UW68 189 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TEX43Q6ZNM6 134 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LINC00173Q6ZV60 143 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OLIG3Q7RTU3 272 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 VN1R4Q7Z5H5 301 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SPATA19Q7Z5L4 167 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MOB3BQ86TA1 216 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLC26A11Q86WA9 606 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 STHQ8IWL8 128 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 STK40Q8N2I9 435 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZADH2Q8N4Q0 377 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C3orf22Q8N5N4 141 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR5T1Q8NG75 326 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR11H7Q8NGC8 314 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR51F2Q8NH61 342 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PIFOQ8TCI5 191 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PTX4Q96A99 478 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TIMM17AQ99595 171 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLC35A5Q9BS91 424 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ACPTQ9BZG2 426 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GBA3Q9H227 469 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CCDC68Q9H2F9 335 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LPAR2Q9HBW0 351 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CALYQ9NYX4 217 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SHPKQ9UHJ6 478 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLC7A11Q9UPY5 501 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CCL26Q9Y258 94 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CCL27Q9Y4X3 112 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CREBBPQ92793 2442 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PCDH15Q96QU1 1955 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZMYM6O95789 1325 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KMT2AQ03164 3969 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GRIFINA4D1Z8 144 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 F8W036 122 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 H3BQ85 93 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NVLO15381 856 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZBTB14O43829 449 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SCO1O75880 301 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PGM3O95394 542 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OXTP01178 125 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LGALS2P05162 132 aa-0.86□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms