RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640094.1

HLA-B-257, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

BASIC

Gene HLA-B, Length 147 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-257ENST00000640094 APLNRP35414 380 aa7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 UCP2P55851 309 aa7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 ERVS71-1P61550 626 aa7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 PLP2Q04941 152 aa7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 EGR4Q05215 589 aa7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 PUDPQ08623 228 aa7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 CASP8Q14790 479 aa7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 SLC36A2Q495M3 483 aa7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 PHYHD1Q5SRE7 291 aa7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 LRRN1Q6UXK5 716 aa7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 RHOUQ7L0Q8 258 aa7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 SERPINA11Q86U17 422 aa7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 VRK2Q86Y07 508 aa7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 MIER2Q8N344 545 aa7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 SLC22A24Q8N4F4 322 aa7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 OR1J1Q8NGS3 322 aa7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 UPRTQ96BW1 309 aa7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 C3orf30Q96M34 536 aa7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 CCDC115Q96NT0 180 aa7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 PANX1Q96RD7 426 aa7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 RHOXF2Q9BQY4 288 aa7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 RNF121Q9H920 327 aa7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 NANOGQ9H9S0 305 aa7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 TCF7L1Q9HCS4 588 aa7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 NOX4Q9NPH5 578 aa7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 MMP26Q9NRE1 261 aa7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 KIF17Q9P2E2 1029 aa7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 KLHL21Q9UJP4 597 aa7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF232Q9UNY5 417 aa7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 RNF114Q9Y508 228 aa7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 POMT1Q9Y6A1 747 aa7.29□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 A0A087WUJ7 227 aa7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 TRAPPC2LH3BP13 241 aa7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 KRT75O95678 551 aa7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 BCHEP06276 602 aa7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 SBK2P0C263 348 aa7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 KRT4P19013 534 aa7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 TNFSF4P23510 183 aa7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 CPT2P23786 658 aa7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 S100A3P33764 101 aa7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 SLC6A9P48067 706 aa7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 AQP5P55064 265 aa7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 BPIFB3P59826 476 aa7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 NCALDP61601 193 aa7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 BTG1P62324 171 aa7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF718Q3SXZ3 478 aa7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 NRN1LQ496H8 165 aa7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 SPANXN4Q5MJ08 99 aa7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 GPR157Q5UAW9 335 aa7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 ASPHD2Q6ICH7 369 aa7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 SLC16A14Q7RTX9 510 aa7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 C1orf174Q8IYL3 243 aa7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 OR6S1Q8NH40 331 aa7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 APOPT1Q96IL0 206 aa7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 EMC6Q9BV81 110 aa7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 SPATA9Q9BWV2 254 aa7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 MARCH7Q9H992 704 aa7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 NPHS2Q9NP85 383 aa7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 MKS1Q9NXB0 559 aa7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 C1RLQ9NZP8 487 aa7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 SELENONQ9NZV5 590 aa7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 KLHL14Q9P2G3 628 aa7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 ASH2LQ9UBL3 628 aa7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 BTNL2Q9UIR0 455 aa7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 IFT52Q9Y366 437 aa7.28□□□□□ -1.24
HLA-B-257ENST00000640094 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 C5orf63A6NC05 138 aa7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 CCDC154A6NI56 674 aa7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 F5H0A9 414 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 SERPINI2O75830 405 aa7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 CD55P08174 381 aa7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 PATE4P0C8F1 98 aa7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 CCL2P13500 99 aa7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 PRG2P13727 222 aa7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 SELEP16581 610 aa7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 TNFRSF1AP19438 455 aa7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 MDH2P40926 338 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 MMP15P51511 669 aa7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 HSF2Q03933 536 aa7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 PAX8Q06710 450 aa7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 ALG10BQ5I7T1 473 aa7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF620Q6ZNG0 422 aa7.27□□□□□ -1.25
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