RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359238.6

SNX11-201, Transcript of sorting nexin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX11, Length 2,315 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11-201ENST00000359238 GNB5O14775 395 aa16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 OR5F1O95221 314 aa16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 CCR9P51686 369 aa16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 CCDC157Q569K6 752 aa16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 PLA2G2CQ5R387 149 aa16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 PXKQ7Z7A4 578 aa16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 ACBD7Q8N6N7 88 aa16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 OR5W2Q8NH69 310 aa16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 DMRTA2Q96SC8 542 aa16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 DPH1Q9BZG8 443 aa16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 NAP1L6A6NFF2 107 aa16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 FAM74A7A6NL05 159 aa16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 HIST1H2ABP04908 130 aa16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 H2AFB1P0C5Y9 115 aa16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 CD226Q15762 336 aa16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 DECR1Q16698 335 aa16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 FAM74A3Q4VXF1 159 aa16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 EIPR1Q53HC9 387 aa16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 RHBDD2Q6NTF9 364 aa16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 MED25Q71SY5 747 aa16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 C9orf40Q8IXQ3 194 aa16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 OR5M9Q8NGP3 310 aa16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 ABHD4Q8TB40 342 aa16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 HIST1H2ACQ93077 130 aa16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 LOXL4Q96JB6 756 aa16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 ART5Q96L15 291 aa16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 TIMP4Q99727 224 aa16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 ALG8Q9BVK2 526 aa16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 OR10A4Q9H209 315 aa16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 HRASLSQ9HDD0 168 aa16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 Q9N2J8 555 aa16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 CLEC4AQ9UMR7 237 aa16.87■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 SLC2A10O95528 541 aa16.86■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 AK1P00568 194 aa16.86■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 HPP00738 406 aa16.86■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 RAB3BP20337 219 aa16.86■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 RPL35P42766 123 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 FGL1Q08830 312 aa16.86■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 SERTAD2Q14140 314 aa16.86■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa16.86■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 TEX19Q8NA77 164 aa16.86■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 LRRC46Q96FV0 321 aa16.86■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 GAL3ST4Q96RP7 486 aa16.86■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 SEC22CQ9BRL7 303 aa16.86■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 PLEKHA1Q9HB21 404 aa16.86■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 FBXL3Q9UKT7 428 aa16.86■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 SRPK3Q9UPE1 567 aa16.86■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 TRAPPC13A5PLN9 417 aa16.86■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 PRSS44E7EML9 344 aa16.86■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 TEX46H3BTG2 121 aa16.86■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 PLPP2O43688 288 aa16.86■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 ZGLP1P0C6A0 271 aa16.86■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 RAD52P43351 418 aa16.86■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 PGGHGQ32M88 737 aa16.86■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 OR5M10Q6IEU7 315 aa16.86■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 ARL9Q6T311 187 aa16.86■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 CDH26Q8IXH8 852 aa16.86■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 OR51G2Q8NGK0 314 aa16.86■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 FANK1Q8TC84 345 aa16.86■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 ADIPOR1Q96A54 375 aa16.86■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 FANCFQ9NPI8 374 aa16.86■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 MED11Q9P086 117 aa16.86■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 NDRG3Q9UGV2 375 aa16.86■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 EFCAB7A8K855 629 aa16.85■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 F8W036 122 aa16.85■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 SOCS6O14544 535 aa16.85■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 WISP1O95388 367 aa16.85■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 STAT5AP42229 794 aa16.85■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 AKR1D1P51857 326 aa16.85■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 PRSS45Q7RTY3 260 aa16.85■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 MEIOBQ8N635 442 aa16.85■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 STT3BQ8TCJ2 826 aa16.85■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 AUNIPQ9H7T9 357 aa16.85■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 KLHL1Q9NR64 748 aa16.85■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 COA4Q9NYJ1 87 aa16.85■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 MMACHCQ9Y4U1 282 aa16.85■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 KMT2EQ8IZD2 1858 aa16.85■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 DMXL1Q9Y485 3027 aa16.85■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 A0A1B0GWA3 101 aa16.85■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 SC5DO75845 299 aa16.85■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 KDM4BO94953 1096 aa16.85■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 ECDO95905 644 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
SNX11-201ENST00000359238 ZNF141Q15928 474 aa16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms