RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550658.1

SYF2P1-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SYF2P1, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2P1-201ENST00000550658 FUT6P51993 359 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 AP1S1P61966 158 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM3AP98173 230 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 DHODHQ02127 395 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 TNFRSF9Q07011 255 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 FOXF2Q12947 444 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 GNMTQ14749 295 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 MAPK14Q16539 360 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 NDUFA9Q16795 377 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 DGUOKQ16854 277 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 EIPR1Q53HC9 387 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 ASPRV1Q53RT3 343 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 RAB6CQ53S08 254 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 TIMM23BQ5SRD1 257 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 MEDAGQ5VYS4 303 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 NIPAL1Q6NVV3 410 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 STEAP1BQ6NZ63 245 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 EMBQ6PCB8 327 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 BTNL3Q6UXE8 466 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF836Q6ZNA1 936 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 PTF1AQ7RTS3 328 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 DPPA2Q7Z7J5 298 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM139Q8IV31 216 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 CMTM1Q8IZ96 169 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 GBGT1Q8N5D6 347 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 UBL4BQ8N7F7 174 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 C15orf54Q8N8G6 183 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 TEX45Q8NA69 505 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 OR2L5Q8NG80 312 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 OR11H4Q8NGC9 324 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 OR4K2Q8NGD2 314 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 OR1B1Q8NGR6 318 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 COQ8AQ8NI60 647 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 FGFBP3Q8TAT2 258 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 CNIH3Q8TBE1 160 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 ACTRT1Q8TDG2 376 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 KCTD4Q8WVF5 259 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 BAALCQ8WXS3 180 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 DNASE2BQ8WZ79 361 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 OLFM3Q96PB7 478 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 PSMB7Q99436 277 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 PHB2Q99623 299 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 DHRS9Q9BPW9 319 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC35A5Q9BS91 424 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 APOOQ9BUR5 198 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 RAB6CQ9H0N0 254 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 PCBD2Q9H0N5 130 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 GAREM1Q9H706 876 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC38A7Q9NVC3 462 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 SDHAF2Q9NX18 166 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC17A6Q9P2U8 582 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 B4GALT7Q9UBV7 327 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 STUB1Q9UNE7 303 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 LAMP3Q9UQV4 416 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 OARD1Q9Y530 152 aa3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SYF2P1-201ENST00000550658 NUP155O75694 1391 aa3.09□□□□□ -1.92
SYF2P1-201ENST00000550658 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa3.09□□□□□ -1.92
SYF2P1-201ENST00000550658 TNRQ92752 1358 aa3.09□□□□□ -1.92
SYF2P1-201ENST00000550658 PTPRGP23470 1445 aa3.09□□□□□ -1.92
SYF2P1-201ENST00000550658 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa3.08□□□□□ -1.92
SYF2P1-201ENST00000550658 TSPAN11A1L157 253 aa3.08□□□□□ -1.92
SYF2P1-201ENST00000550658 EFCAB7A8K855 629 aa3.08□□□□□ -1.92
SYF2P1-201ENST00000550658 TCP10L2B9ZVM9 353 aa3.08□□□□□ -1.92
SYF2P1-201ENST00000550658 E5RJQ4 531 aa3.08□□□□□ -1.92
SYF2P1-201ENST00000550658 LMO7DNF2Z398 122 aa3.08□□□□□ -1.92
SYF2P1-201ENST00000550658 KCNK1O00180 336 aa3.08□□□□□ -1.92
SYF2P1-201ENST00000550658 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
SYF2P1-201ENST00000550658 CCRL2O00421 344 aa3.08□□□□□ -1.92
SYF2P1-201ENST00000550658 RRHO14718 337 aa3.08□□□□□ -1.92
SYF2P1-201ENST00000550658 BET1O15155 118 aa3.08□□□□□ -1.92
SYF2P1-201ENST00000550658 PFDN6O15212 129 aa3.08□□□□□ -1.92
SYF2P1-201ENST00000550658 CRXO43186 299 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
SYF2P1-201ENST00000550658 ZIC3O60481 467 aa3.08□□□□□ -1.92
SYF2P1-201ENST00000550658 DPM1O60762 260 aa3.08□□□□□ -1.92
SYF2P1-201ENST00000550658 ALOX12BO75342 701 aa3.08□□□□□ -1.92
SYF2P1-201ENST00000550658 MPDU1O75352 247 aa3.08□□□□□ -1.92
SYF2P1-201ENST00000550658 CEACAM4O75871 244 aa3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms