RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 PITX2Q99697 317 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 SULT4A1Q9BR01 284 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 CACNG6Q9BXT2 260 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 RRAGCQ9HB90 399 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 RAB6BQ9NRW1 208 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 MTCH1Q9NZJ7 389 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 ATP23Q9Y6H3 246 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 HELTA6NFD8 242 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 FBXO24O75426 580 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 SAP30O75446 220 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 OR4F21O95013 312 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 TNFSF15O95150 251 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 OR6A2O95222 327 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 IGSF6O95976 241 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 SLC10A3P09131 477 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 SFTA3P0C7M3 94 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 CASRP41180 1078 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 BDKRB1P46663 353 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 PJVKQ0ZLH3 352 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 GPR18Q14330 331 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 MELKQ14680 651 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 TGIF1Q15583 401 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 UBE2V2Q15819 145 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 OR4F3Q6IEY1 312 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 OR2C3Q8N628 320 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 FEZF2Q8TBJ5 459 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 STT3BQ8TCJ2 826 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 CASTOR1Q8WTX7 329 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM125Q96AQ2 219 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 SCLYQ96I15 445 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 AKR1E2Q96JD6 320 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 PNMA5Q96PV4 448 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 FSD1LQ9BXM9 530 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 PBX4Q9BYU1 374 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF350Q9GZX5 532 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 SLC25A31Q9H0C2 315 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 MEGF9Q9H1U4 602 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 SCN9AQ15858 1988 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 C7orf77A4D0Y5 90 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 FXYD1O00168 92 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 ARPC3O15145 178 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 HIST1H2BKO60814 126 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 GPR37L1O60883 481 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 WNT11O96014 354 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 SCG5P05408 212 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 HIST1H2BJP06899 126 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 F3P13726 295 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 MSR1P21757 451 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 HIST1H2BOP23527 126 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 HIST1H2BBP33778 126 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 RPL22P35268 128 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 VIPR2P41587 438 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 CYB561P49447 251 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 MMP16P51512 607 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 HIST1H2BDP58876 126 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 HIST1H2BCP62807 126 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 HBA1P69905 142 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 PTSQ03393 145 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 ABHD18Q0P651 414 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 SSX1Q16384 188 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 HIST2H2BEQ16778 126 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 CARD16Q5EG05 197 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 PRRT3Q5FWE3 981 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 SPRED2Q7Z698 418 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 STEAP2Q8NFT2 490 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 HIST1H2BHQ93079 126 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 PNPLA2Q96AD5 504 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 EPYCQ99645 322 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 HIST1H2BNQ99877 126 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 HIST1H2BMQ99879 126 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 HDAC8Q9BY41 377 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 HEBP1Q9NRV9 189 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 TAS2R13Q9NYV9 303 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 RNF150Q9ULK6 438 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 RNF212BA8MTL3 300 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 MFNGO00587 321 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 SLC16A5O15375 505 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 FGF16O43320 207 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 TSPAN15O95858 294 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 ELLP55199 621 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 DAOAP59103 153 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 RHEBQ15382 184 aa5.68□□□□□ -1.5
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