RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598594.1

PAF1-208, Transcript of PAF1 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component, human

TSL 2

Gene PAF1, Length 280 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAF1-208	ENST00000598594	IL36A	Q9UHA7	158 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	STUB1	Q9UNE7	303 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	TFR2	Q9UP52	801 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	TCF19	Q9Y242	345 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ABCB11	O95342	1321 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	C15orf62	A8K5M9	175 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	PP2D1	A8MPX8	630 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	CCRL2	O00421	344 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	PLPP1	O14494	284 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	WNT9B	O14905	357 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	MAGEC1	O60732	1142 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	UGT2B17	O75795	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ANXA9	O76027	345 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	MPZL1	O95297	269 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	NDUFA10	O95299	355 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	C1orf105	O95561	183 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ANGPTL1	O95841	491 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	PLAU	P00749	431 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	CALB1	P05937	261 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	CR2	P20023	1033 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	DNA2	P51530	1060 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	XG	P55808	180 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	CTSW	P56202	376 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	AQP6	Q13520	282 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	UBE2V2	Q15819	145 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	POU2AF1	Q16633	256 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	BSX	Q3C1V8	233 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	FGD3	Q5JSP0	725 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	DRAM2	Q6UX65	266 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	STK40	Q8N2I9	435 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	OR4F5	Q8NH21	305 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	NELFB	Q8WX92	580 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	PIK3R3	Q92569	461 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	YIPF6	Q96EC8	236 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	SDSL	Q96GA7	329 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ABHD8	Q96I13	439 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	SERPINB12	Q96P63	405 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	OR4F4	Q96R69	305 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	STAC	Q99469	402 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	IFT46	Q9NQC8	304 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	RNF114	Q9Y508	228 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	NUP155	O75694	1391 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594		A0A1W2PQ67	120 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	LILRA5	A6NI73	299 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594		A8MVM7	634 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	INPP4B	O15327	924 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	KIAA0513	O60268	411 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	CTNS	O60931	367 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	ESRRB	O95718	433 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	IGSF6	O95976	241 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	WNT11	O96014	354 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	TIMP1	P01033	207 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	CDK1	P06493	297 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	SLC2A1	P11166	492 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	UCHL3	P15374	230 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PAF1-208	ENST00000598594	MAGEA12	P43365	314 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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